286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2006 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 522 aa  1070    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  57.61 
 
 		 528 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  58.1 
 
 		 497 aa  597  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  51.18 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  48.15 
 
 		 523 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  49.55 
 
 		 497 aa  431  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  46.51 
 
 		 507 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  46.37 
 
 		 511 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  49.16 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  49.36 
 
 		 506 aa  425  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  46.2 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  46.31 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  45.03 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  45.29 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  43.65 
 
 		 509 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  45.2 
 
 		 538 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  45.09 
 
 		 514 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  46.2 
 
 		 510 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  45.29 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  45.08 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  45.49 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  45.09 
 
 		 516 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  43.8 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  45.08 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  47.12 
 
 		 520 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  45.29 
 
 		 513 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  45.7 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  45.7 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  44.88 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  45.7 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  45.67 
 
 		 514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  45.29 
 
 		 510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  45.88 
 
 		 526 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  45.06 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  49.31 
 
 		 503 aa  403  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  45.08 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  44.13 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  44.58 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  46.07 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  45.83 
 
 		 518 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  45.57 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  45.57 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  45.57 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  45.57 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  45.47 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  45.36 
 
 		 506 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  43.5 
 
 		 510 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  44.42 
 
 		 511 aa  398  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  44.35 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  42.34 
 
 		 510 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0149  histidine ammonia-lyase  44.89 
 
 		 523 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  43.76 
 
 		 515 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  43.84 
 
 		 505 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  44.59 
 
 		 511 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  44.92 
 
 		 517 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  45.68 
 
 		 508 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  44.18 
 
 		 506 aa  395  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  45.06 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  43.71 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  44.61 
 
 		 510 aa  391  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  43.78 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  46.5 
 
 		 508 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  43.42 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2716  histidine ammonia-lyase  46.93 
 
 		 526 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  46.71 
 
 		 508 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  43.42 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  43.78 
 
 		 510 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67320  histidine ammonia-lyase  44.92 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  42.29 
 
 		 507 aa  383  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  45.3 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  45.09 
 
 		 511 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1160  histidine ammonia-lyase  43.1 
 
 		 544 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  44.97 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2855  histidine ammonia-lyase  46.59 
 
 		 522 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  46.5 
 
 		 508 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  45.53 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  44.3 
 
 		 518 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  42.22 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  43.38 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  43.13 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  42.16 
 
 		 507 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  45.82 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  43.25 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  44.16 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 		 510 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  44.96 
 
 		 518 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5831  histidine ammonia-lyase  45.16 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4085  histidine ammonia-lyase  43.84 
 
 		 510 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5637  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 		 518 aa  379  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  43.18 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  44.12 
 
 		 511 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  44.44 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>