More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0562 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  100 
 
 		 299 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  44.68 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  42.24 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  38.6 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  37.88 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  34.34 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  32.29 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  35.91 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  34.59 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  35.43 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  36.68 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  34.71 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  33.8 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  34.53 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  32.43 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  34.72 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  30.42 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  27.55 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  31.72 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  31.21 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  31.21 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  29.43 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  33.85 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  34.15 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  29.69 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.29 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  29.88 
 
 		 325 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  29.68 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.33 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.19 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.7 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.88 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  28.23 
 
 		 333 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  27.62 
 
 		 327 aa  96.3  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.6 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  26.12 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  25.47 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  25.47 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  25.39 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  23.79 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  24.84 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  26.73 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  27.69 
 
 		 329 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  26.17 
 
 		 323 aa  85.9  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  29.57 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  25.91 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.13 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  27.03 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  25.39 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1720  putative carbohydrate kinase  24.85 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259189  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  25.39 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  28.89 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  27.66 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  26.9 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  25.17 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  24.34 
 
 		 645 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  26.12 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  24.6 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  25.43 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  27.5 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  26.06 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  25.85 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  27.63 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  24.6 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  22.44 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  29.02 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  27.68 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  24.16 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  25.08 
 
 		 628 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  25 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.68 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  26.47 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  27.8 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  27.33 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  24.75 
 
 		 628 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  24.91 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  24.09 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  25.87 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  26.71 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  24.85 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  26.77 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  25.55 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  26.99 
 
 		 659 aa  72.4  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  24.32 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  26.89 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  26.15 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  27.05 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  23.33 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  26.89 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  26.71 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  25.16 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  28.01 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  23.45 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.4 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.4 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.4 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  22.91 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>