76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2500 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 1300 aa  2619    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  29.84 
 
 		 1821 aa  255  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  32.7 
 
 		 4630 aa  249  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  25.48 
 
 		 1279 aa  149  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  26.92 
 
 		 2042 aa  123  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  32.22 
 
 		 570 aa  115  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  23.02 
 
 		 1361 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  29.97 
 
 		 1048 aa  112  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  35.56 
 
 		 1009 aa  112  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  23.62 
 
 		 1316 aa  98.2  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  30.82 
 
 		 331 aa  96.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  36.46 
 
 		 437 aa  90.9  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  35.47 
 
 		 981 aa  88.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  36.2 
 
 		 1831 aa  88.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  36.28 
 
 		 1467 aa  81.6  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  37.14 
 
 		 1937 aa  76.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  37.59 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  24.38 
 
 		 892 aa  75.5  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  25.09 
 
 		 799 aa  75.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  26.42 
 
 		 1732 aa  73.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  33.56 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 		 1077 aa  69.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  31.96 
 
 		 942 aa  68.6  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0948  Ig domain-containing protein  36.26 
 
 		 129 aa  68.6  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000631459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  47.62 
 
 		 526 aa  67.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  21.69 
 
 		 1281 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  34.38 
 
 		 462 aa  66.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  46.25 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  31.5 
 
 		 2638 aa  63.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  27.49 
 
 		 399 aa  60.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  35.43 
 
 		 316 aa  61.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  33.85 
 
 		 220 aa  60.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  31.67 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.7 
 
 		 752 aa  58.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1141  Ig-like domain-containing protein  33.71 
 
 		 132 aa  57.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000187348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1352  hypothetical protein  32.58 
 
 		 132 aa  57  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0931121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  25.67 
 
 		 472 aa  57  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  33.33 
 
 		 576 aa  56.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  26.95 
 
 		 472 aa  56.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1390  hypothetical protein  32.58 
 
 		 132 aa  56.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149321  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  38.96 
 
 		 524 aa  55.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  36.52 
 
 		 1193 aa  54.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1313  hypothetical protein  30.34 
 
 		 132 aa  55.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.20671e-18 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  32.2 
 
 		 730 aa  54.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1133  hypothetical protein  30.34 
 
 		 132 aa  55.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000201206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  45.68 
 
 		 1226 aa  55.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  36.11 
 
 		 1421 aa  54.3  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1153  hypothetical protein  30.34 
 
 		 132 aa  55.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1245  hypothetical protein  30.34 
 
 		 132 aa  55.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4056  hypothetical protein  29.21 
 
 		 132 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000793338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  28.57 
 
 		 2353 aa  53.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  43.9 
 
 		 306 aa  53.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1127  hypothetical protein  29.21 
 
 		 132 aa  53.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  39.02 
 
 		 1418 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2642  Ig domain protein group 2 domain protein  28.57 
 
 		 889 aa  53.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2588  hypothetical protein  34.97 
 
 		 195 aa  53.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  25.81 
 
 		 905 aa  52.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1288  hypothetical protein  28.09 
 
 		 132 aa  52.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0295288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  24.7 
 
 		 1180 aa  51.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0086  hypothetical protein  40.24 
 
 		 248 aa  50.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3328  Ig domain-containing protein  31.45 
 
 		 878 aa  50.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2102  Ig-like domain-containing protein  40.96 
 
 		 372 aa  50.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  32.05 
 
 		 554 aa  49.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  27.56 
 
 		 575 aa  49.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  30.3 
 
 		 867 aa  48.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1511  surface protein  40.43 
 
 		 1065 aa  48.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  28.87 
 
 		 600 aa  47.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3430  Ig domain-containing protein  30.86 
 
 		 241 aa  47.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0205063  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0362  Ig-like domain-containing protein  26.97 
 
 		 647 aa  48.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3264  Ig domain-containing protein  32.14 
 
 		 262 aa  47  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0666  hypothetical protein  47.17 
 
 		 110 aa  47.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  34.78 
 
 		 983 aa  46.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1063  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1263 aa  46.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  34.88 
 
 		 640 aa  46.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  23.64 
 
 		 466 aa  46.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0826  sulfatase  37.68 
 
 		 627 aa  45.1  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000772105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>