23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0666 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0666  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  49.09 
 
 		 1732 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  42.68 
 
 		 437 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  50 
 
 		 526 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  50 
 
 		 556 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  46.03 
 
 		 1048 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  48.98 
 
 		 428 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  45.16 
 
 		 1821 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  46.15 
 
 		 1418 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  47.17 
 
 		 1300 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2102  Ig-like domain-containing protein  38.6 
 
 		 372 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  41.18 
 
 		 1009 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  41.51 
 
 		 2638 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  46.15 
 
 		 981 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  45.76 
 
 		 1937 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  45.76 
 
 		 1467 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  37.93 
 
 		 1077 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  35.19 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  43.64 
 
 		 4630 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  36.11 
 
 		 983 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  41.18 
 
 		 1831 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0826  sulfatase  35.19 
 
 		 627 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000772105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  43.9 
 
 		 942 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>