59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2102 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2102  Ig-like domain-containing protein  100 
 
 
372 aa  746    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0355  hypothetical protein  46.44 
 
 
274 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0346  hypothetical protein  46.44 
 
 
274 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1137  hypothetical protein  41.79 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1772  hypothetical protein  40.91 
 
 
258 aa  192  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  52.13 
 
 
1821 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  33.14 
 
 
556 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  46.24 
 
 
981 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  53.57 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  50 
 
 
526 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  51.85 
 
 
1732 aa  76.6  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  51.81 
 
 
1048 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  42.22 
 
 
1009 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  50 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  34.31 
 
 
2638 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  28.8 
 
 
576 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  44.74 
 
 
428 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  36.96 
 
 
4630 aa  63.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  37.08 
 
 
1831 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3370  Ig domain-containing protein  44.19 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  43.18 
 
 
1418 aa  59.3  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  36.59 
 
 
524 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  38.46 
 
 
554 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  40.96 
 
 
1300 aa  56.6  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  38.89 
 
 
220 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1068  Ig domain-containing protein  36.56 
 
 
151 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.383445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1088  Ig domain-containing protein  36.56 
 
 
151 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.704248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  35.09 
 
 
1077 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  40.96 
 
 
1171 aa  53.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  43.37 
 
 
1226 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0948  Ig domain-containing protein  35.56 
 
 
129 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000631459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  35.11 
 
 
600 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0086  hypothetical protein  32.99 
 
 
248 aa  50.4  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  37.04 
 
 
1937 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  37.04 
 
 
1467 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0362  Ig-like domain-containing protein  33.33 
 
 
647 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318383  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  36.14 
 
 
1193 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1245  hypothetical protein  25.81 
 
 
132 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1133  hypothetical protein  25.81 
 
 
132 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000201206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1153  hypothetical protein  25.81 
 
 
132 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1313  hypothetical protein  25.81 
 
 
132 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.20671e-18 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  35.37 
 
 
983 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1288  hypothetical protein  26.61 
 
 
132 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0295288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4056  hypothetical protein  25.81 
 
 
132 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000793338  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1127  hypothetical protein  25 
 
 
132 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0666  hypothetical protein  38.6 
 
 
110 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1390  hypothetical protein  25 
 
 
132 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1352  hypothetical protein  25 
 
 
132 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0931121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  33.33 
 
 
570 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  27.59 
 
 
1556 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  33.85 
 
 
462 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1148  gifsy-2 prophage VmtV  35.16 
 
 
249 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1076  gifsy-2 prophage VmtV  35.16 
 
 
249 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.016765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1141  Ig-like domain-containing protein  23.39 
 
 
132 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000187348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  37.88 
 
 
942 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1413  gifsy-2 prophage VmtV  35.16 
 
 
249 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  41.1 
 
 
1421 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0905  gp13  34.21 
 
 
247 aa  42.7  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  38.27 
 
 
472 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>