More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0282 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
213 aa  441  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  68.54 
 
 
213 aa  318  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  65.73 
 
 
213 aa  298  4e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  65.73 
 
 
213 aa  295  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  62.74 
 
 
226 aa  293  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  61.97 
 
 
215 aa  286  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  55.66 
 
 
218 aa  256  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  38.64 
 
 
220 aa  165  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  40.67 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  40.47 
 
 
214 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 
202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  36 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 
459 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 
459 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
459 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  38.1 
 
 
459 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
459 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.3 
 
 
235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  36.41 
 
 
213 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.02 
 
 
346 aa  124  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
459 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
467 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  32.47 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  32.64 
 
 
235 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.15 
 
 
233 aa  118  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.39 
 
 
354 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  33.62 
 
 
464 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  35.67 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.29 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  39.9 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 
470 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.87 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.41 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 
470 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
617 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 
209 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.43 
 
 
471 aa  109  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  33 
 
 
205 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 
471 aa  109  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.38 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 
251 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 
238 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  33.82 
 
 
201 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.79 
 
 
480 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  33.16 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.7 
 
 
226 aa  108  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  33.97 
 
 
217 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 
209 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  36.13 
 
 
229 aa  106  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  31.78 
 
 
469 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  32.41 
 
 
238 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 
238 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 
212 aa  105  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.2 
 
 
209 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  37.37 
 
 
218 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  31.94 
 
 
237 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 
206 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 
217 aa  104  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 
209 aa  104  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  35.68 
 
 
455 aa  104  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  37.88 
 
 
218 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
444 aa  104  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  32.29 
 
 
258 aa  104  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 
205 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 
201 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  34.35 
 
 
450 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 
218 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  36.12 
 
 
459 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  32.21 
 
 
346 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
470 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  35.68 
 
 
461 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 
222 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 
209 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 
459 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  37.43 
 
 
244 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31656  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.7 
 
 
255 aa  102  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.976065  normal  0.697857 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  31.8 
 
 
464 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 
208 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  34.18 
 
 
237 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
460 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  33.17 
 
 
232 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 
464 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  35.03 
 
 
246 aa  102  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.37 
 
 
239 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
242 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.67 
 
 
229 aa  102  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 
213 aa  101  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  31.41 
 
 
233 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  31.94 
 
 
228 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  31.25 
 
 
346 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.22 
 
 
472 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
249 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>