88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0797 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  100 
 
 		 336 aa  687    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  57.19 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  57.81 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  56.88 
 
 		 331 aa  364  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  56.88 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  54.61 
 
 		 306 aa  320  9.999999999999999e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  52.87 
 
 		 327 aa  318  1e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  54.11 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  43.73 
 
 		 339 aa  279  6e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  43.73 
 
 		 339 aa  279  6e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  43.41 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  43.41 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  43.41 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  43.41 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  43.41 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  43.75 
 
 		 334 aa  275  8e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.81 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  43.39 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  43.05 
 
 		 340 aa  255  6e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  43.05 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  42.71 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  42.37 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  41.69 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.32 
 
 		 321 aa  242  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.45 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.45 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  43.81 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  43.05 
 
 		 337 aa  238  9e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  44.41 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.41 
 
 		 317 aa  236  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.42 
 
 		 322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.71 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.61 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.61 
 
 		 317 aa  232  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.64 
 
 		 301 aa  230  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.93 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.2 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.74 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.51 
 
 		 317 aa  218  8.999999999999998e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.86 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.55 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.68 
 
 		 324 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.37 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.72 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.79 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.42 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.07 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.21 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.34 
 
 		 329 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.72 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.94 
 
 		 329 aa  205  7e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.02 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.02 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.12 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  40.28 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  31.51 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  33.33 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.47 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  32.17 
 
 		 308 aa  156  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.62 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  32.98 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  31.36 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  29.29 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  31.93 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.62 
 
 		 290 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  32.17 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.12 
 
 		 303 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  28.81 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.32 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.09 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  26.62 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  27.88 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  31.68 
 
 		 298 aa  116  6e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  26.69 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  26.73 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  31.7 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  33.22 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  32.89 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  24.48 
 
 		 570 aa  97.1  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  25.72 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  24.83 
 
 		 601 aa  89.4  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  28.33 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  22.87 
 
 		 576 aa  73.2  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  22.87 
 
 		 576 aa  73.2  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  24.32 
 
 		 691 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  26.54 
 
 		 713 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50377  predicted protein  38.6 
 
 		 755 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2469  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.43 
 
 		 102 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>