81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0810 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  100 
 
 		 400 aa  806    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  63.75 
 
 		 400 aa  530  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  61.54 
 
 		 467 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  62.66 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  63.07 
 
 		 400 aa  497  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  59.6 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  56.5 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  37.55 
 
 		 1085 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  29.36 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  29.2 
 
 		 772 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.49 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  28.57 
 
 		 760 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.54 
 
 		 348 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.54 
 
 		 348 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  29.75 
 
 		 1351 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  28.44 
 
 		 1112 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  28.44 
 
 		 1070 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  28.44 
 
 		 1070 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  27.73 
 
 		 760 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  31.18 
 
 		 1088 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.66 
 
 		 766 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  26.89 
 
 		 765 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  27.94 
 
 		 531 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  24.55 
 
 		 772 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  27.23 
 
 		 779 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  30.05 
 
 		 347 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1052 aa  90.9  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  26.47 
 
 		 766 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  26.05 
 
 		 755 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  24.9 
 
 		 542 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  25.81 
 
 		 954 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  25.81 
 
 		 1012 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  27.55 
 
 		 995 aa  87  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  31.49 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  31.08 
 
 		 789 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  31.08 
 
 		 789 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  35.47 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  30 
 
 		 858 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  25.97 
 
 		 565 aa  80.5  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  23.96 
 
 		 993 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  35 
 
 		 877 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  27.68 
 
 		 994 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  27.91 
 
 		 643 aa  73.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  22.58 
 
 		 1011 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  31.66 
 
 		 312 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  30.82 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  36.13 
 
 		 587 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  25.45 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  27.23 
 
 		 718 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  29.46 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  31.96 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  33.33 
 
 		 631 aa  63.5  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  27.39 
 
 		 863 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  28.36 
 
 		 692 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  32.48 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  35.9 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  22.34 
 
 		 535 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  31.46 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.91 
 
 		 1679 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  31.62 
 
 		 205 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  31.37 
 
 		 197 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  30.69 
 
 		 776 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  27.66 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6120  hypothetical protein  21.76 
 
 		 211 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  25.46 
 
 		 279 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1231 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  27.47 
 
 		 1290 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  27.01 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0153  internalin G  26.23 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.44 
 
 		 1086 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0953  hypothetical protein  26.1 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5088  internalin G  26.23 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.63 
 
 		 892 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  31.01 
 
 		 523 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  23.77 
 
 		 618 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.07 
 
 		 1091 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  26.32 
 
 		 1335 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4766  internalin G  28.48 
 
 		 254 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0508  hypothetical protein  28.24 
 
 		 238 aa  43.9  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1105  hypothetical protein  29.94 
 
 		 314 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000125481  normal  0.311601 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  27.78 
 
 		 1780 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>