More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0270 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  100 
 
 		 503 aa  1022    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  68.25 
 
 		 463 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  66.05 
 
 		 482 aa  637    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  70.95 
 
 		 474 aa  661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  65.24 
 
 		 483 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  66.32 
 
 		 483 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.01 
 
 		 485 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  63.71 
 
 		 507 aa  616  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  63.91 
 
 		 570 aa  610  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  70.31 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  64.73 
 
 		 495 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  68.53 
 
 		 492 aa  587  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  60.9 
 
 		 529 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  49.26 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  51.35 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  50.99 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  45.2 
 
 		 527 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  41.18 
 
 		 509 aa  286  8e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  39.61 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  43.45 
 
 		 539 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  43.88 
 
 		 539 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  42.96 
 
 		 538 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  42.96 
 
 		 535 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  32.81 
 
 		 650 aa  249  6e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 		 240 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.05 
 
 		 246 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 278 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19413  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  42.86 
 
 		 251 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.05 
 
 		 246 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.94 
 
 		 258 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 247 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 247 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 289 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.2 
 
 		 247 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 227 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 		 233 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 264 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  29.94 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 265 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 		 254 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4069  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 		 239 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  29.14 
 
 		 254 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  38.54 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 286 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 257 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.54 
 
 		 308 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 		 254 aa  51.2  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 246 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 246 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 269 aa  50.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 277 aa  50.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 		 246 aa  50.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 256 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  40 
 
 		 254 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 		 292 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.082877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 		 255 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 254 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 314 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 256 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 259 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1626  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.44 
 
 		 245 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 239 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.58 
 
 		 254 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  26.67 
 
 		 288 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 246 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 326 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 246 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 328 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 266 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 		 260 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  27.96 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06640  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  41.67 
 
 		 309 aa  48.9  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 300 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 248 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 		 246 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 298 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 255 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 254 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 253 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 		 255 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 246 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 253 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 255 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 292 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  28.41 
 
 		 251 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 254 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>