More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2265 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  56.09 
 
 
739 aa  834    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  56.94 
 
 
727 aa  852    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  100 
 
 
727 aa  1488    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  59.97 
 
 
734 aa  933    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  61.67 
 
 
738 aa  946    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  59.97 
 
 
734 aa  931    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  45.14 
 
 
760 aa  633  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  43.79 
 
 
747 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  42.96 
 
 
717 aa  600  1e-170  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  40.47 
 
 
721 aa  577  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  40 
 
 
738 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  61.42 
 
 
455 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  40.95 
 
 
716 aa  556  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  41.4 
 
 
716 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  40.17 
 
 
759 aa  550  1e-155  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  39.8 
 
 
721 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  38.02 
 
 
722 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  38.61 
 
 
715 aa  513  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  36.84 
 
 
1040 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  61.27 
 
 
521 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  36.2 
 
 
908 aa  478  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  34.85 
 
 
906 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  34.72 
 
 
906 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.73 
 
 
908 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.67 
 
 
1018 aa  465  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  37.45 
 
 
1018 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 
1038 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  33.84 
 
 
1011 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  37.03 
 
 
1018 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 
1038 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.25 
 
 
1019 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.8 
 
 
1013 aa  443  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  32.22 
 
 
1042 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  33.19 
 
 
722 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.94 
 
 
1024 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  32.41 
 
 
722 aa  385  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  32.25 
 
 
731 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.75 
 
 
741 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  33.19 
 
 
725 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  33.52 
 
 
714 aa  379  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  33.33 
 
 
730 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  31.98 
 
 
715 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  32.64 
 
 
716 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  31.35 
 
 
736 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.41 
 
 
739 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  32.96 
 
 
728 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  31.85 
 
 
728 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.08 
 
 
1008 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.08 
 
 
1008 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  31.88 
 
 
731 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  31.71 
 
 
728 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  30.33 
 
 
725 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.78 
 
 
720 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.42 
 
 
865 aa  365  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  30.29 
 
 
726 aa  365  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  29.92 
 
 
726 aa  365  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.69 
 
 
1000 aa  364  4e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  30.66 
 
 
724 aa  363  6e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  30.66 
 
 
724 aa  363  6e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  30.45 
 
 
737 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  32 
 
 
743 aa  360  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  31.33 
 
 
750 aa  360  4e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  33.43 
 
 
700 aa  360  7e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  31.48 
 
 
738 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  31.14 
 
 
705 aa  355  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  30.1 
 
 
743 aa  352  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  30.81 
 
 
930 aa  350  6e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  31.48 
 
 
735 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.25 
 
 
1003 aa  350  8e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  29.66 
 
 
712 aa  346  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  30.47 
 
 
892 aa  346  8.999999999999999e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.86 
 
 
999 aa  345  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.97 
 
 
1013 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.45 
 
 
1012 aa  343  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.62 
 
 
1006 aa  342  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 
720 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.05 
 
 
1016 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  32.03 
 
 
699 aa  341  2.9999999999999998e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  32.1 
 
 
720 aa  341  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  29.74 
 
 
741 aa  340  7e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.87 
 
 
721 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  30.4 
 
 
720 aa  339  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.63 
 
 
1001 aa  338  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  29.93 
 
 
748 aa  331  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  30.87 
 
 
753 aa  330  6e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  29.92 
 
 
975 aa  329  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  30.9 
 
 
986 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  29.14 
 
 
1717 aa  328  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  35.21 
 
 
714 aa  328  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  30.07 
 
 
706 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  30.21 
 
 
721 aa  326  9e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  32.6 
 
 
980 aa  325  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  29.49 
 
 
727 aa  324  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.45 
 
 
976 aa  323  8e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  28.27 
 
 
714 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0890  ABC transporter related protein  28.5 
 
 
771 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  28.67 
 
 
723 aa  321  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  28.67 
 
 
723 aa  321  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  27.38 
 
 
714 aa  321  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  30.53 
 
 
982 aa  321  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>