More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1714 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 234 aa  318  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  60.7 
 
 		 231 aa  272  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  56.58 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  56.83 
 
 		 231 aa  265  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.75 
 
 		 236 aa  227  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.12 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  49.34 
 
 		 227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  48.67 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2327  two-component response regulator  50.66 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 227 aa  214  8e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2933  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 235 aa  207  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 		 237 aa  207  9e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 236 aa  204  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 233 aa  202  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  46.75 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  47.83 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 227 aa  197  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.35 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 261 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  42.41 
 
 		 225 aa  192  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  45.49 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8764  response regulator receiver protein  42.36 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  41.85 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  42.22 
 
 		 256 aa  188  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.61 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  44.49 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.15 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  41.13 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  42.92 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 237 aa  185  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 247 aa  185  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  42.49 
 
 		 248 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  42.49 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 321 aa  185  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 222 aa  184  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 237 aa  184  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  44 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  40.89 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>