244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0094 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
708 aa  1444    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  54.52 
 
 
489 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  38.51 
 
 
525 aa  218  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  39.12 
 
 
480 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  36.11 
 
 
838 aa  191  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  35.86 
 
 
486 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  34.51 
 
 
537 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  32.35 
 
 
541 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  34.07 
 
 
519 aa  170  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  30.6 
 
 
531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  31.85 
 
 
568 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  32.41 
 
 
471 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  33.09 
 
 
858 aa  162  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  36.64 
 
 
570 aa  160  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  30.45 
 
 
637 aa  156  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  30.88 
 
 
858 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  30.88 
 
 
858 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0305  flagellar hook-associated protein FlgK  37.25 
 
 
620 aa  152  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  34.5 
 
 
583 aa  150  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 
586 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  29.74 
 
 
818 aa  144  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  35.63 
 
 
613 aa  142  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  28.64 
 
 
478 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  31.64 
 
 
463 aa  135  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  28.32 
 
 
846 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 
847 aa  132  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  30.1 
 
 
623 aa  131  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  28.87 
 
 
477 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  31.43 
 
 
443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  30.34 
 
 
477 aa  128  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  27.05 
 
 
627 aa  125  3e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  31.7 
 
 
532 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  31.64 
 
 
638 aa  120  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
465 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  30.16 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  31.23 
 
 
642 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  30.85 
 
 
647 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  32.1 
 
 
645 aa  112  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  32.1 
 
 
645 aa  112  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  26.48 
 
 
463 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.35 
 
 
475 aa  109  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  25.18 
 
 
696 aa  107  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  27.6 
 
 
920 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2563  flagellar hook-associated protein FlgK  27.23 
 
 
481 aa  104  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  25.94 
 
 
458 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  27.17 
 
 
459 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.62 
 
 
685 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  26.83 
 
 
680 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  27.93 
 
 
680 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  27.82 
 
 
629 aa  102  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  26.97 
 
 
472 aa  101  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  31 
 
 
641 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0672  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 
430 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0730204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  28.88 
 
 
697 aa  100  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  29.13 
 
 
702 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  29.19 
 
 
566 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  37.78 
 
 
464 aa  98.6  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  27.53 
 
 
690 aa  98.2  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  27.24 
 
 
682 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  27.95 
 
 
482 aa  95.9  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  30.22 
 
 
631 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
560 aa  96.3  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
682 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  25.34 
 
 
683 aa  95.5  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  27.93 
 
 
683 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  25.81 
 
 
698 aa  95.5  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  26.99 
 
 
464 aa  95.1  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  25.35 
 
 
453 aa  95.1  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 
631 aa  94.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  27.15 
 
 
588 aa  93.6  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  29.13 
 
 
637 aa  92.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  27.34 
 
 
608 aa  90.1  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1640  flagellar hook-associated protein FlgK  27.34 
 
 
608 aa  89  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  30.54 
 
 
681 aa  89  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  27.56 
 
 
640 aa  88.6  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  28.29 
 
 
657 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1459  flagellar hook-associated protein FlgK  27.34 
 
 
608 aa  88.6  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  29.2 
 
 
458 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  25.62 
 
 
482 aa  87.8  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  26.21 
 
 
676 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0566  flagellar hook-associated protein FlgK  24.06 
 
 
628 aa  87.4  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  29.2 
 
 
458 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  26.54 
 
 
466 aa  87  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  24.9 
 
 
715 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  26.19 
 
 
652 aa  86.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  26.75 
 
 
644 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  29.82 
 
 
657 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  24.78 
 
 
453 aa  85.9  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  25.96 
 
 
653 aa  85.5  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 
549 aa  85.1  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  26.09 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  26.98 
 
 
632 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  28.17 
 
 
659 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  27.35 
 
 
640 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  25.6 
 
 
681 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  27.02 
 
 
695 aa  83.2  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  29.96 
 
 
482 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  25.49 
 
 
688 aa  83.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 
480 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0391  flagellar hook-associated protein FlgK  25.2 
 
 
484 aa  82.4  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0799381  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>