162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1835 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 331 aa  653    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  39.94 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1710  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2000  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18395  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  39.75 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0092  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  55.78 
 
 		 359 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 377 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  38.72 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  41.29 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  55.22 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0787  anti-sigma-factor antagonist  39.19 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1239  anti-sigma-factor antagonist  44.32 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.974707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3278  anti-sigma-factor antagonist  31.99 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2635  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  45.26 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  40.97 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  43.51 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  41.84 
 
 		 271 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  39.18 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  37.97 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  41.8 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  41.8 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  47.37 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  36.69 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 		 568 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  40.94 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  49.5 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2986  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  39.53 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  40.28 
 
 		 430 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  42.96 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  37.76 
 
 		 521 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  43.8 
 
 		 271 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.32 
 
 		 272 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  43.9 
 
 		 653 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  41.1 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  35.53 
 
 		 523 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  39.61 
 
 		 559 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  40.46 
 
 		 445 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 509 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 439 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  42.61 
 
 		 562 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 280 aa  95.9  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  37.68 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  41.73 
 
 		 252 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  43.9 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  39.26 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.96 
 
 		 284 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 376 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  40.34 
 
 		 655 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  37.33 
 
 		 284 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  43.36 
 
 		 667 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  36.03 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  37.3 
 
 		 255 aa  92.8  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 433 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  35.34 
 
 		 288 aa  92.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  29.5 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  45.54 
 
 		 653 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  33.57 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  28.45 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  37.32 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 357 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  39.23 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  35.07 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  39.23 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  34.62 
 
 		 286 aa  89.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  41.46 
 
 		 388 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  39.26 
 
 		 549 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  35.51 
 
 		 538 aa  89.4  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 292 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  37.9 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  32.45 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  34.35 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  37.2 
 
 		 377 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  34.75 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  33.92 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  37.66 
 
 		 231 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  38.21 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  39.67 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2659  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  40.29 
 
 		 424 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  38.35 
 
 		 653 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  34.73 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.17 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  32.79 
 
 		 350 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.39 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  36.64 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  41.82 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  36.51 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  38.97 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  33.53 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>