More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1657 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  100 
 
 
592 aa  1213    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.65 
 
 
591 aa  711    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  55.23 
 
 
589 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.55 
 
 
582 aa  623  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.99 
 
 
583 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.81 
 
 
573 aa  531  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  47.13 
 
 
585 aa  513  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  41.45 
 
 
966 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 
624 aa  299  9e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.9 
 
 
596 aa  289  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  32.25 
 
 
990 aa  289  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  35.18 
 
 
604 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.45 
 
 
953 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.96 
 
 
1018 aa  277  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  33.89 
 
 
971 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
600 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  33.57 
 
 
1007 aa  270  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  31.19 
 
 
992 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.48 
 
 
534 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.48 
 
 
534 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  32.38 
 
 
1012 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  36.49 
 
 
1003 aa  265  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.6 
 
 
568 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.37 
 
 
698 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.97 
 
 
976 aa  261  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.91 
 
 
543 aa  261  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  31.44 
 
 
997 aa  259  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.87 
 
 
1002 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.4 
 
 
558 aa  254  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  31.25 
 
 
520 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  32.41 
 
 
552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.81 
 
 
537 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  42.11 
 
 
656 aa  242  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.61 
 
 
528 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.25 
 
 
618 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.62 
 
 
552 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  45.13 
 
 
542 aa  224  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.95 
 
 
543 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  37.17 
 
 
427 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  27.77 
 
 
845 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.8 
 
 
511 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  32.72 
 
 
631 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.15 
 
 
511 aa  210  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.32 
 
 
420 aa  210  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.15 
 
 
580 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  39.42 
 
 
492 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  42.16 
 
 
538 aa  206  9e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.56 
 
 
426 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  39.12 
 
 
543 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  33 
 
 
444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  36.2 
 
 
538 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  28.07 
 
 
557 aa  196  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  36.28 
 
 
549 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  28.31 
 
 
517 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  31.72 
 
 
699 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.82 
 
 
598 aa  190  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  27.82 
 
 
688 aa  189  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  45.04 
 
 
498 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  37.15 
 
 
503 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.39 
 
 
484 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  35.58 
 
 
699 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.91 
 
 
490 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  35.32 
 
 
699 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  39.87 
 
 
520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  35.32 
 
 
699 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  27.2 
 
 
528 aa  183  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  27.62 
 
 
541 aa  183  9.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.46 
 
 
365 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  39.46 
 
 
365 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  28.6 
 
 
478 aa  179  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.12 
 
 
365 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  40.27 
 
 
499 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.13 
 
 
594 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  30.23 
 
 
537 aa  174  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  31.75 
 
 
633 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.69 
 
 
504 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  30.83 
 
 
586 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2780  glycoside hydrolase family protein  29.96 
 
 
562 aa  168  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.330179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 
386 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  39.26 
 
 
365 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  36.18 
 
 
544 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  28.6 
 
 
637 aa  167  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.76 
 
 
490 aa  167  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1615  glycoside hydrolase family 3 protein  27.38 
 
 
523 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.059462  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  29.49 
 
 
779 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  35.59 
 
 
544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77156  glycosyl hyrolase family 3-like protein  25.08 
 
 
1010 aa  164  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.354705  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  29.08 
 
 
759 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  26.63 
 
 
923 aa  163  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  30.64 
 
 
734 aa  163  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.66 
 
 
499 aa  162  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.67 
 
 
361 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  34.31 
 
 
531 aa  160  5e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.46 
 
 
482 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22490  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.62 
 
 
412 aa  159  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.796827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  37.78 
 
 
575 aa  157  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2890  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.5 
 
 
553 aa  156  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  30.41 
 
 
673 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.12 
 
 
573 aa  154  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  37.98 
 
 
575 aa  153  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>