197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5420 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  77.78 
 
 
764 aa  1114    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  100 
 
 
759 aa  1489    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  65.31 
 
 
453 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  68.52 
 
 
424 aa  538  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  58.14 
 
 
497 aa  500  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 
468 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  57.67 
 
 
469 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  59.96 
 
 
468 aa  480  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  57.92 
 
 
461 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  56.1 
 
 
494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  56.33 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  57.33 
 
 
453 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  55.9 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  60.83 
 
 
405 aa  459  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  59.5 
 
 
451 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  55.36 
 
 
442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  59.17 
 
 
445 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  55.09 
 
 
445 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  54.06 
 
 
434 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  53.41 
 
 
446 aa  432  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  54.71 
 
 
471 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  52.71 
 
 
456 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  50.1 
 
 
497 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  51.81 
 
 
441 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  52.51 
 
 
454 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4970  aminopeptidase-like protein  53.96 
 
 
442 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.53 
 
 
1103 aa  74.7  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  26.67 
 
 
574 aa  69.7  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  29.82 
 
 
363 aa  66.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  27.17 
 
 
424 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  30.63 
 
 
360 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  27.09 
 
 
323 aa  62.4  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  37.04 
 
 
338 aa  62.4  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.64 
 
 
377 aa  62  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  25.35 
 
 
333 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  29.78 
 
 
394 aa  60.8  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
642 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
642 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  23.74 
 
 
322 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  24.65 
 
 
315 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  27.9 
 
 
346 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  28.67 
 
 
346 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4968  putative flavoprotein  30.36 
 
 
357 aa  58.9  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.73 
 
 
361 aa  58.9  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.03 
 
 
361 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  29.61 
 
 
318 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  31.65 
 
 
448 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1820  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  26.67 
 
 
454 aa  58.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  32.26 
 
 
393 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  27.54 
 
 
346 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  28.07 
 
 
346 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  33.56 
 
 
342 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  32.1 
 
 
384 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  27.95 
 
 
420 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  30.61 
 
 
341 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  32.1 
 
 
386 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  33.33 
 
 
398 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  32.99 
 
 
775 aa  56.6  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  24.44 
 
 
422 aa  55.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.7 
 
 
362 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2792  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.36 
 
 
322 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505261  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  30.56 
 
 
447 aa  55.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  31.75 
 
 
319 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  36.75 
 
 
584 aa  55.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.62 
 
 
330 aa  55.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.36 
 
 
362 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.41 
 
 
369 aa  55.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.84 
 
 
598 aa  54.7  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
494 aa  54.7  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  28.57 
 
 
571 aa  54.7  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.08 
 
 
357 aa  54.7  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  30.43 
 
 
557 aa  54.3  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  23.36 
 
 
327 aa  54.3  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  29.53 
 
 
539 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.71 
 
 
363 aa  53.9  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  28.28 
 
 
416 aa  53.5  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2770  hypothetical protein  30.94 
 
 
641 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.911109  normal  0.95794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4033  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.4 
 
 
527 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  21.71 
 
 
330 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  38.71 
 
 
450 aa  52.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  22.84 
 
 
352 aa  52.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  30.97 
 
 
1147 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1138  monooxygenase flavin-binding family protein  29.33 
 
 
497 aa  52  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139531  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.53 
 
 
358 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  30 
 
 
528 aa  52  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  30.98 
 
 
558 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  30.98 
 
 
558 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2740  hypothetical protein  30.39 
 
 
641 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.97 
 
 
516 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2784  hypothetical protein  30.39 
 
 
641 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.11 
 
 
674 aa  51.6  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  26.19 
 
 
325 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  28.46 
 
 
506 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  26.62 
 
 
347 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  29.48 
 
 
1077 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  34.34 
 
 
518 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  27.16 
 
 
466 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  41.24 
 
 
323 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  29.58 
 
 
625 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  24.83 
 
 
407 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>