More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3562 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 429 aa  828    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  49.2 
 
 		 703 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  48.49 
 
 		 689 aa  303  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  40.2 
 
 		 756 aa  279  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  45.93 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  40.45 
 
 		 715 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  40.45 
 
 		 715 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  46.04 
 
 		 416 aa  259  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  41.61 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  38.73 
 
 		 764 aa  253  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  40.58 
 
 		 482 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  44.92 
 
 		 683 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  39.8 
 
 		 747 aa  249  8e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  40.3 
 
 		 723 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  41.08 
 
 		 775 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  39.59 
 
 		 715 aa  237  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  44.62 
 
 		 416 aa  232  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  40.85 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  37.32 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  36.73 
 
 		 767 aa  218  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  38.26 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  35.85 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  33.66 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  32.93 
 
 		 816 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  35.52 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  33.96 
 
 		 951 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  36.9 
 
 		 883 aa  186  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  37.14 
 
 		 422 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  35.84 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.41 
 
 		 430 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  32.82 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 		 410 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.23 
 
 		 442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  30.62 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  35.21 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  34.61 
 
 		 460 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  34.72 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.46 
 
 		 410 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.52 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  34.35 
 
 		 410 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 750 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  34.61 
 
 		 573 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 		 435 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  33.83 
 
 		 406 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  34.76 
 
 		 452 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  34.08 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.64 
 
 		 547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.91 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.91 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  30.91 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.91 
 
 		 625 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  30.91 
 
 		 592 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.91 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 		 749 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 		 748 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 		 435 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.69 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.69 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  30.69 
 
 		 444 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3230  sodium/hydrogen exchanger  30.91 
 
 		 401 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  29.43 
 
 		 404 aa  113  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  26.57 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.13 
 
 		 386 aa  102  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  25.59 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.67 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.46 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 389 aa  96.7  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25.13 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.87 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.87 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.87 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.87 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.87 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  28.02 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.87 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.62 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.87 
 
 		 387 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.01 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  24.02 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.09 
 
 		 427 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  26.58 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  25.3 
 
 		 423 aa  89.7  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 		 712 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 767 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>