155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2426 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 		 288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  70.91 
 
 		 283 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  66.67 
 
 		 284 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  67.78 
 
 		 276 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  62.45 
 
 		 280 aa  346  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  63.93 
 
 		 290 aa  342  4e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  68.46 
 
 		 285 aa  342  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  59.65 
 
 		 282 aa  341  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  62.22 
 
 		 274 aa  336  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  60.52 
 
 		 304 aa  331  8e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  59.03 
 
 		 278 aa  328  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  60.22 
 
 		 302 aa  328  9e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  61.87 
 
 		 273 aa  325  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  57.91 
 
 		 282 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  60.36 
 
 		 282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  62.99 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  59.42 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  61.48 
 
 		 270 aa  312  4.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  60.51 
 
 		 279 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  57.61 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  61.99 
 
 		 272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  60.93 
 
 		 288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  59.01 
 
 		 280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  57.93 
 
 		 280 aa  292  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  54.2 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  54.48 
 
 		 289 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  55.39 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  60.91 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  52.29 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  50.55 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  50.72 
 
 		 306 aa  254  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1015  20S proteasome, A and B subunits  54.02 
 
 		 282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.410005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  51.72 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  51.72 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  51.72 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12142  proteasome beta subunit prcB  50.38 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000259602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  35.48 
 
 		 207 aa  116  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  33.95 
 
 		 211 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  36.06 
 
 		 212 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  32.72 
 
 		 219 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  32.72 
 
 		 219 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  31.34 
 
 		 219 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  32.06 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  31.8 
 
 		 219 aa  99.8  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  34.67 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  33.66 
 
 		 210 aa  97.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  30.92 
 
 		 211 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  32.86 
 
 		 209 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  33.5 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  30.92 
 
 		 213 aa  86.3  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  29.63 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  31.35 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  33.69 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  29.41 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  32.14 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  32.68 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.95 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  27.37 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  32.63 
 
 		 217 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  30.14 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  30.64 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  29.44 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  28.64 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.76 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  28.71 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  27.94 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  26.29 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  25.48 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  27.87 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  27.94 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  28.37 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  27.36 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  32.26 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  28.29 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  29.35 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.52 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  29.74 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  25.44 
 
 		 199 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  31.87 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  27.12 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  27.75 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.27 
 
 		 210 aa  54.3  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.89 
 
 		 187 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  24.4 
 
 		 213 aa  53.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  26.09 
 
 		 203 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  26.63 
 
 		 196 aa  52.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.7 
 
 		 185 aa  52.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2740  ATP-dependent protease peptidase subunit  29.83 
 
 		 176 aa  52.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  28.12 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.63 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  26.51 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  27.62 
 
 		 180 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  25.54 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.57 
 
 		 176 aa  50.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  27.23 
 
 		 272 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  25.95 
 
 		 204 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.57 
 
 		 176 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  28.57 
 
 		 176 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.57 
 
 		 176 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.57 
 
 		 176 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>