252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1587 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 180 aa  370  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  80.57 
 
 		 179 aa  298  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.09 
 
 		 180 aa  291  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0030  ATP-dependent protease peptidase subunit  75 
 
 		 179 aa  279  2e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 		 180 aa  233  8e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.36 
 
 		 182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1877  20S proteasome A and B subunits  65.12 
 
 		 183 aa  230  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.254644  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.85 
 
 		 182 aa  226  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 		 183 aa  225  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.52 
 
 		 183 aa  225  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.11 
 
 		 180 aa  224  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 180 aa  224  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 		 182 aa  223  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 		 181 aa  223  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 180 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1439  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 		 182 aa  222  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 		 180 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 		 180 aa  222  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.54 
 
 		 182 aa  221  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 		 178 aa  220  8e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1175  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 		 182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.107278  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 		 180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.67 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 		 204 aa  214  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.18 
 
 		 176 aa  214  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 		 181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.39 
 
 		 182 aa  213  8e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  55.37 
 
 		 180 aa  213  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.69 
 
 		 194 aa  213  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 		 180 aa  213  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.39 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 		 182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 		 186 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.67 
 
 		 181 aa  211  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.01 
 
 		 181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 		 186 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 		 178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1546  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.54 
 
 		 183 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 		 182 aa  210  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.87 
 
 		 184 aa  209  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 		 176 aa  209  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.41 
 
 		 176 aa  210  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 		 176 aa  209  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.07 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 		 176 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.82 
 
 		 176 aa  208  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 		 178 aa  208  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 		 186 aa  207  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 		 184 aa  207  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.41 
 
 		 176 aa  207  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1310  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 		 181 aa  207  7e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 		 190 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0131  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.63 
 
 		 178 aa  207  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0440313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.02 
 
 		 176 aa  207  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 		 176 aa  206  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.47 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.55 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  57.39 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.24 
 
 		 176 aa  206  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 		 206 aa  206  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.82 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  58.82 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.82 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.82 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.82 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.82 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.12 
 
 		 182 aa  205  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.82 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.88 
 
 		 174 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  58.82 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.82 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.8 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.47 
 
 		 183 aa  205  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.8 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.5 
 
 		 178 aa  204  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 		 176 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 		 176 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 		 176 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 		 176 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 		 176 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0343  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.19 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.47 
 
 		 174 aa  202  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 		 176 aa  202  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.17 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>