61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0915 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0915  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00714947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  49.73 
 
 
326 aa  174  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  50.59 
 
 
326 aa  169  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  43.45 
 
 
330 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.47044e-06 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  42.86 
 
 
330 aa  139  2e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.46 
 
 
327 aa  135  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.42 
 
 
321 aa  130  1e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  34.69 
 
 
360 aa  130  1e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  37.65 
 
 
331 aa  126  2e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.68 
 
 
331 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  37.93 
 
 
331 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  31.46 
 
 
330 aa  123  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.57 
 
 
330 aa  121  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  31.25 
 
 
333 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.91 
 
 
331 aa  116  2e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  37.16 
 
 
331 aa  115  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  34.3 
 
 
330 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  32.39 
 
 
333 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  31.21 
 
 
330 aa  113  1e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.46 
 
 
331 aa  113  1e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.84 
 
 
333 aa  113  2e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  29.35 
 
 
331 aa  111  7e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  34.62 
 
 
330 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  29.94 
 
 
330 aa  109  2e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.79 
 
 
330 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  36.11 
 
 
334 aa  107  7e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.69 
 
 
330 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.67 
 
 
319 aa  104  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.72 
 
 
333 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.9 
 
 
338 aa  99.4  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  34.88 
 
 
330 aa  96.3  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.22 
 
 
330 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.68 
 
 
328 aa  91.3  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
384 aa  90.9  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  30.51 
 
 
322 aa  84  1e-15  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.27 
 
 
329 aa  80.1  1e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  28.74 
 
 
332 aa  80.1  2e-14  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  32.73 
 
 
321 aa  80.1  2e-14  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  27.72 
 
 
335 aa  78.2  6e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  29.44 
 
 
333 aa  78.2  6e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.67 
 
 
326 aa  75.9  3e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  26.74 
 
 
332 aa  72.8  3e-12  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  25.29 
 
 
326 aa  69.3  3e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1169  hypothetical protein  35.63 
 
 
93 aa  59.7  2e-08  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0784464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  26.67 
 
 
325 aa  58.5  5e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  1.23897e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  26.67 
 
 
325 aa  58.2  7e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  32.41 
 
 
259 aa  57.8  9e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  25.88 
 
 
336 aa  51.6  7e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  19.77 
 
 
334 aa  49.3  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.5 
 
 
544 aa  48.1  7e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  20.73 
 
 
325 aa  47.8  8e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  19.78 
 
 
350 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  21.56 
 
 
553 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.36 
 
 
347 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.3 
 
 
334 aa  45.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  20.95 
 
 
325 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  20.83 
 
 
331 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  21.97 
 
 
339 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  24.31 
 
 
545 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.08 
 
 
330 aa  42.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  24.09 
 
 
334 aa  41.2  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>