72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1546 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  100 
 
 		 242 aa  478  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  48.56 
 
 		 244 aa  238  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  46.12 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  47.35 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  48.87 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  51.65 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  46.28 
 
 		 241 aa  205  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  45.83 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  36.63 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  40.91 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  31.84 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  35.25 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  34.3 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  33.06 
 
 		 244 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  31.15 
 
 		 891 aa  128  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  33.88 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  33.2 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  32.1 
 
 		 972 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.4 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  35.42 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  28.23 
 
 		 977 aa  109  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.82 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  33.2 
 
 		 998 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  33.88 
 
 		 964 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.01 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  33.74 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  30.74 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  30.08 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  26.69 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  31.3 
 
 		 244 aa  85.5  8e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  24.79 
 
 		 770 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  26.05 
 
 		 248 aa  72  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  24.9 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  25.3 
 
 		 736 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.22 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  31.35 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  26.34 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  30.06 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 768 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  29.9 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.02 
 
 		 748 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  29.65 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.2 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  30.89 
 
 		 932 aa  45.4  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  26.15 
 
 		 767 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  25.76 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  30 
 
 		 929 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  26.32 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  24.41 
 
 		 922 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  38.3 
 
 		 330 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  31.36 
 
 		 1106 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 368 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 		 341 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  32.84 
 
 		 386 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  42  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  25.53 
 
 		 921 aa  41.6  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  33.91 
 
 		 276 aa  41.6  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  27.48 
 
 		 911 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>