More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0207 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  100 
 
 		 417 aa  858    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  63.9 
 
 		 424 aa  552  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  66.02 
 
 		 423 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  61.95 
 
 		 437 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  64.08 
 
 		 423 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  61.54 
 
 		 420 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  61.3 
 
 		 420 aa  535  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  61.54 
 
 		 420 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  61.3 
 
 		 420 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  61.65 
 
 		 412 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  61.06 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  61.06 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  61.06 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  61.06 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  60.82 
 
 		 420 aa  531  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  61.69 
 
 		 420 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  62.75 
 
 		 418 aa  519  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  60.77 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  61.52 
 
 		 414 aa  505  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  58.66 
 
 		 414 aa  485  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  54.76 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  55.13 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  55.13 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  48.43 
 
 		 416 aa  426  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  48.2 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  48.2 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  48.2 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  49.12 
 
 		 420 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  48.08 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  46.8 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  46.51 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  47.13 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  46.42 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  46.06 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  45.3 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  44.6 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  44.12 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  46.99 
 
 		 423 aa  362  5.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  47.3 
 
 		 431 aa  362  6e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  45.37 
 
 		 418 aa  359  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  45.37 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  47.32 
 
 		 429 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  45.73 
 
 		 439 aa  355  8.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  46.77 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  42.5 
 
 		 457 aa  352  8e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  45.72 
 
 		 412 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  45.7 
 
 		 408 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  46.8 
 
 		 408 aa  338  9e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  44.83 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  44.02 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  42.49 
 
 		 514 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  41.95 
 
 		 507 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 509 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  41.16 
 
 		 503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  38.67 
 
 		 514 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.84 
 
 		 506 aa  282  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  39.84 
 
 		 506 aa  282  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  39.24 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  39.24 
 
 		 511 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  40.47 
 
 		 503 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  40.59 
 
 		 507 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  40.45 
 
 		 516 aa  276  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  41.62 
 
 		 606 aa  275  7e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  39.02 
 
 		 511 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  44.88 
 
 		 505 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  40.11 
 
 		 509 aa  273  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  39.52 
 
 		 507 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  38.38 
 
 		 526 aa  272  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  39.25 
 
 		 507 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  39.25 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  40.31 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  39.83 
 
 		 501 aa  269  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  41.93 
 
 		 505 aa  268  8.999999999999999e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  38.13 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  42.51 
 
 		 503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  37.87 
 
 		 504 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0413  threonine dehydratase  39.84 
 
 		 519 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  38.11 
 
 		 513 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  41.16 
 
 		 504 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  39.06 
 
 		 514 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  41.18 
 
 		 507 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  38.86 
 
 		 515 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  40.99 
 
 		 502 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  39.46 
 
 		 527 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  38.48 
 
 		 524 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  38.59 
 
 		 515 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  40.53 
 
 		 506 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  38.48 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  42.56 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  40.64 
 
 		 535 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  40.91 
 
 		 535 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  40.64 
 
 		 507 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  40.64 
 
 		 507 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  40.64 
 
 		 507 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  40.64 
 
 		 507 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  43.59 
 
 		 550 aa  260  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  40.64 
 
 		 507 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  40.37 
 
 		 507 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  43.59 
 
 		 510 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  43.3 
 
 		 512 aa  260  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>