85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1226 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 327 aa  655    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  33.11 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  33.11 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  30.3 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  30.92 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  31.54 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  29.84 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  29.51 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  30.03 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  29.28 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  29.28 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  29.28 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  29.43 
 
 		 268 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  26.97 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  27.54 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  29.76 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  27.06 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  27.42 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  27.74 
 
 		 317 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  25.24 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  29.19 
 
 		 227 aa  99.4  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.77 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  30.59 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  25.73 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  20.32 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  21.61 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  20.32 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  20.32 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  20.32 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  20.32 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  20.32 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  20.32 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  20.32 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  20.32 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  22.14 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  20.07 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  23.16 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  23.47 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  21.99 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  20.75 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  19.12 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  19.12 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  19.12 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  19.12 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  19.12 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  22.12 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  19.78 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  19.78 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  17.92 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  19.06 
 
 		 460 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  24.46 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  26.7 
 
 		 401 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0820  Co/Zn/Cd cation transporter  20.75 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00173784  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  19.78 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  19.79 
 
 		 460 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  23.61 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  19.64 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  22.78 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  21.27 
 
 		 388 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  20.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  23.85 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  19.47 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  24.18 
 
 		 422 aa  46.2  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  20.1 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0922  cation efflux protein  24.67 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.134705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  23.2 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  23.45 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  29.67 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  21.51 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  18.25 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  20.94 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  21.51 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  21.51 
 
 		 385 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  21.89 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  17.19 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.83 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  18.87 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>