More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0100 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  100 
 
 		 170 aa  336  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  51.3 
 
 		 191 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  45.57 
 
 		 186 aa  110  9e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  43.2 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  64.29 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  59.55 
 
 		 152 aa  91.7  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  43.79 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  43.79 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  50 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  52.81 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  40 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  38.18 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  39.09 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  33.88 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  54.55 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  76.92 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  45.16 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  73.68 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  44.58 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  61.54 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  68.42 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  38.36 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  38.36 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1480  transformation system protein  49.18 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.754405  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.89 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.07 
 
 		 121 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.65 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  47.27 
 
 		 67 aa  53.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  67.65 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  43.42 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  49.15 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  37.89 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  37.89 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  37.89 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  30.43 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  36.84 
 
 		 205 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  36.84 
 
 		 205 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  36.84 
 
 		 205 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  37.89 
 
 		 205 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  36.84 
 
 		 205 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  65.71 
 
 		 136 aa  51.2  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  62.86 
 
 		 218 aa  50.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  62.86 
 
 		 201 aa  50.8  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.93 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.34 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  65 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  62.86 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  48.78 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.03 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  32.37 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  65.71 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  61.11 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  58.33 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  26.21 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  39.73 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  40.85 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  60 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  60 
 
 		 201 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  62.86 
 
 		 187 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  58.33 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  50 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  57.14 
 
 		 212 aa  48.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  35.63 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  34.38 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.92 
 
 		 167 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  50.94 
 
 		 231 aa  47.8  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.84 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  28.32 
 
 		 140 aa  47.8  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  28.32 
 
 		 140 aa  47.8  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  58.33 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  30.93 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.71 
 
 		 155 aa  47.4  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  36.9 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  24.74 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  50 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  34.17 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  32.39 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  32.91 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  25.14 
 
 		 338 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  76.92 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  52.63 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  33.72 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>