152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07881 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  420  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  54.29 
 
 
183 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  55.71 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  47.93 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  55.71 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  52.7 
 
 
185 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  52.86 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  53.57 
 
 
189 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  53.57 
 
 
187 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  52.14 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  54.29 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  51.43 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  54.29 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  50.7 
 
 
193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  48.94 
 
 
184 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  53.57 
 
 
191 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  52.86 
 
 
184 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  49.66 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  52.14 
 
 
183 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  52.11 
 
 
191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  44.81 
 
 
195 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  52.14 
 
 
184 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  49.32 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  44.83 
 
 
185 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  43.78 
 
 
194 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  50 
 
 
184 aa  131  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  51.43 
 
 
184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  48.2 
 
 
190 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  48.2 
 
 
190 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  48.57 
 
 
194 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  48.57 
 
 
194 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  47.86 
 
 
189 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  45.27 
 
 
187 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  45.39 
 
 
156 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  45.27 
 
 
187 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  44.74 
 
 
156 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  43.06 
 
 
160 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  45.58 
 
 
166 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  45.14 
 
 
166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  40.26 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  42.36 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  41.78 
 
 
163 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  44.22 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  41.43 
 
 
161 aa  109  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  49.58 
 
 
157 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  41.04 
 
 
202 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.18 
 
 
186 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  40.97 
 
 
165 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  36.81 
 
 
238 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  42.76 
 
 
208 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.28 
 
 
220 aa  101  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  41.78 
 
 
133 aa  101  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.24 
 
 
558 aa  101  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.31 
 
 
133 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  38.16 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
134 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3054  beta-Ig-H3/fasciclin  39.85 
 
 
179 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  39.04 
 
 
354 aa  96.3  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  37.13 
 
 
178 aa  95.9  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  40.5 
 
 
190 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  38 
 
 
167 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  42.14 
 
 
160 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  39.5 
 
 
194 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  36.11 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  35.37 
 
 
133 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.57 
 
 
141 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  36.81 
 
 
133 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  36.81 
 
 
133 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  29.12 
 
 
279 aa  85.1  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  40.32 
 
 
157 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  37.11 
 
 
596 aa  84.7  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  35.19 
 
 
200 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.1 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  33.18 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.71 
 
 
308 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  34.69 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.89 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  32.43 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2303  beta-Ig-H3/fasciclin  30.99 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00674889 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  38.66 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  37.24 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  35.53 
 
 
611 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  33.83 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  34.31 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.19 
 
 
139 aa  72  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  32.55 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  36.09 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  34.56 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  34.9 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  37.8 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  32.73 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  35.17 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  32.73 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  35.09 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  30.54 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  34.31 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  31.78 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  29.33 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  27.59 
 
 
143 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  29.14 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>