278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01730 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  100 
 
 		 226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  38.22 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.56 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  35.65 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  28.97 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  29.44 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  30.36 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  26.64 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  28.05 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  28.3 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  27.92 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  27.31 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  30.48 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  25.52 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.19 
 
 		 243 aa  89  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  25.21 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.51 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  30.7 
 
 		 221 aa  88.2  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  27.18 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  26.52 
 
 		 267 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  27.16 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  24.69 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.12 
 
 		 238 aa  85.1  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  26.94 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  30.04 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  27.08 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  28.26 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  27.42 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  27.8 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  26.42 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  32.23 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  28.25 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  25.82 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  27.23 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.96 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  27.39 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  27.39 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  23.89 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  26.84 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  25.45 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  28.09 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  25.89 
 
 		 271 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  27.83 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  25.35 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  27.5 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  26.91 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  26.13 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  23.95 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  26.69 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  23.95 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  25.12 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  25.86 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  27.73 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  29.49 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  26.67 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  26.36 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  28.57 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  26.09 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  26.69 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  25.63 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  31.01 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  26.8 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  24.48 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  30.41 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  26.55 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  25.89 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  23.74 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  27.5 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  25.94 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  25.52 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  26.02 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.48 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  25.89 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  30.71 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  26.21 
 
 		 235 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  34.48 
 
 		 240 aa  72  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  30.71 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  26.55 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  25.71 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>