More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0220 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 290 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  42.21 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  44.33 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  42.21 
 
 		 290 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 309 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  41.22 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  38.19 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 290 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 603 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 603 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 603 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.46 
 
 		 603 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 603 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.65 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  38.65 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.44 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  38.65 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  33.12 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.81 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.12 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  41.01 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.12 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.12 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 316 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 309 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 316 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 316 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.02 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 287 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.62 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.54 
 
 		 285 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  33.33 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.44 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  32.11 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 291 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 309 aa  151  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.96 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  33.33 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  36.27 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.69 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>