More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1916 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  79.13 
 
 		 208 aa  340  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  69.23 
 
 		 213 aa  317  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  69.23 
 
 		 209 aa  300  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  67.82 
 
 		 208 aa  297  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  69.8 
 
 		 208 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  67.16 
 
 		 207 aa  292  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  67.98 
 
 		 218 aa  292  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  66.83 
 
 		 208 aa  287  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  65.84 
 
 		 207 aa  287  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  65.87 
 
 		 208 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  59.8 
 
 		 210 aa  261  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  56.78 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  29.95 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  35.97 
 
 		 1287 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  29.48 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  29.48 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  30.05 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  30.07 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  34.9 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  29.33 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  27.16 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  25.26 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  38.33 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  33.77 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  23.88 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  30.41 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  31.62 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  29.41 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.97 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  34.31 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  31.68 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  25.26 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  29.41 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  31.73 
 
 		 377 aa  55.1  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  33.01 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  34.82 
 
 		 279 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  34.41 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  29.01 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  31.68 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  31.16 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  28.4 
 
 		 488 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 303 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  36.21 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.41 
 
 		 345 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 2490 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  30.66 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 265 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  25.11 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  30.66 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  26.39 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  30.66 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  29.66 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  32 
 
 		 323 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  30.66 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  30.66 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  28.07 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  30.66 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  30.43 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  32 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  27.37 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.32 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.57 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  33.98 
 
 		 365 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>