More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4359 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  70.61 
 
 		 547 aa  803    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  73.63 
 
 		 555 aa  843    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  69.74 
 
 		 554 aa  772    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 552 aa  1139    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  75 
 
 		 555 aa  837    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  54.45 
 
 		 554 aa  600  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  54.71 
 
 		 557 aa  599  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  51.93 
 
 		 547 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  52.3 
 
 		 547 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  53.33 
 
 		 545 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  51.78 
 
 		 542 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  51.01 
 
 		 544 aa  538  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  34.78 
 
 		 577 aa  281  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  32.74 
 
 		 624 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  29.73 
 
 		 638 aa  244  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.11 
 
 		 584 aa  232  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  30.81 
 
 		 536 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  30.81 
 
 		 536 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  30.81 
 
 		 536 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.96 
 
 		 575 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.78 
 
 		 575 aa  213  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 539 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 563 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  27.98 
 
 		 597 aa  203  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  29.7 
 
 		 581 aa  200  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  29.73 
 
 		 537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 564 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  26.18 
 
 		 576 aa  194  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.65 
 
 		 583 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  27.84 
 
 		 601 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 538 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  29.84 
 
 		 625 aa  191  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  27.86 
 
 		 604 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  28.24 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  29.48 
 
 		 587 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  28.42 
 
 		 581 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.26 
 
 		 549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  31.2 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.28 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  31.13 
 
 		 525 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  27.94 
 
 		 648 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  27.39 
 
 		 650 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  27.73 
 
 		 592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.69 
 
 		 533 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.83 
 
 		 540 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.48 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  29.13 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  28.29 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 620 aa  158  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  29.35 
 
 		 569 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.09 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  28.37 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  28.7 
 
 		 539 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  27.37 
 
 		 583 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  27.37 
 
 		 583 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.12 
 
 		 537 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  27.19 
 
 		 543 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  27.66 
 
 		 530 aa  150  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  28.15 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  25.79 
 
 		 618 aa  148  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  26.6 
 
 		 626 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  26.7 
 
 		 606 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.75 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  26.62 
 
 		 527 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.71 
 
 		 543 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.74 
 
 		 539 aa  143  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  26.6 
 
 		 562 aa  141  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  27.13 
 
 		 553 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.03 
 
 		 556 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  25.8 
 
 		 585 aa  141  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  27.97 
 
 		 556 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.8 
 
 		 543 aa  140  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.16 
 
 		 542 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  24.91 
 
 		 557 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  26.84 
 
 		 541 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  27.75 
 
 		 539 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.03 
 
 		 564 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  26.5 
 
 		 545 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  26.35 
 
 		 576 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  26.45 
 
 		 541 aa  134  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.86 
 
 		 583 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  25.91 
 
 		 563 aa  133  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  28.75 
 
 		 550 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  25.5 
 
 		 527 aa  131  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  26.68 
 
 		 532 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  28.52 
 
 		 550 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  27.23 
 
 		 589 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  27.69 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  28.25 
 
 		 544 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  24.91 
 
 		 546 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  26.74 
 
 		 558 aa  127  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  26.94 
 
 		 560 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  24.28 
 
 		 549 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  22.75 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  26.95 
 
 		 569 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.08 
 
 		 603 aa  125  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  28.08 
 
 		 551 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  24.45 
 
 		 522 aa  124  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  24.17 
 
 		 569 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  24.64 
 
 		 596 aa  124  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>