More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0390 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  100 
 
 
267 aa  553  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
310 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.52 
 
 
345 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.63 
 
 
672 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  29.88 
 
 
305 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
303 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  25.32 
 
 
306 aa  96.3  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  26.41 
 
 
275 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  29.58 
 
 
303 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  27.56 
 
 
310 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  29.29 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  25.65 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.76 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  28.82 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  25.21 
 
 
317 aa  89  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  25.82 
 
 
353 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  27.54 
 
 
240 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  25.82 
 
 
353 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  24.75 
 
 
308 aa  85.9  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  27.98 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  27.05 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  26.88 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  26.92 
 
 
300 aa  82  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  27.59 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  29.53 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  30 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  28.71 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  29.39 
 
 
572 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  25.35 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  24.47 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  25.51 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  22.26 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  25.97 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  22.27 
 
 
607 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.32 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  25.61 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  28.27 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  23.85 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  22.98 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  24.88 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  28.22 
 
 
282 aa  72  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  22.98 
 
 
625 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  27.23 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  30.29 
 
 
488 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  24.88 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  24.14 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0386  hypothetical protein  25.1 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.669351  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  29.93 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  27.23 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  25.89 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  32.19 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  27.85 
 
 
211 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  24.76 
 
 
876 aa  62  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
996 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  25 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  27.06 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  23.26 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  22.92 
 
 
371 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  20.94 
 
 
354 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
207 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
1287 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  25.24 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  28.45 
 
 
415 aa  59.7  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  25.84 
 
 
326 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
206 aa  59.3  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.38 
 
 
303 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  24.89 
 
 
312 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  23.22 
 
 
303 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 
457 aa  59.3  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  32 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  23.93 
 
 
574 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 
211 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  20.92 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  22.66 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  21.59 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  26.43 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  27.2 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  35.05 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
711 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  24.55 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  23.49 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
1177 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.92 
 
 
237 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  24.02 
 
 
383 aa  56.2  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
710 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  22.83 
 
 
447 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  22.83 
 
 
447 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  25.84 
 
 
326 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>