More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0581 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
297 aa  597  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.335118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2693  putative short chain oxidoreductase  68.69 
 
 
299 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.4 
 
 
300 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0553918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5812  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.59 
 
 
299 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.26 
 
 
299 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337193  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.59 
 
 
299 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.59 
 
 
299 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.58 
 
 
297 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.91 
 
 
299 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.2 
 
 
301 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.51 
 
 
299 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.41 
 
 
308 aa  345  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.56 
 
 
308 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3013  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  56.12 
 
 
321 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.29 
 
 
302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64 
 
 
201 aa  188  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 
307 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 
307 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
296 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0965696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
297 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
287 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
285 aa  148  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.387596  hitchhiker  0.000782233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
287 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
292 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.95 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
276 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
329 aa  113  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  38.35 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 
286 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
272 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
273 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.6 
 
 
273 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
268 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.78 
 
 
298 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
280 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 
280 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
279 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 
286 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 
268 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  32.35 
 
 
272 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
268 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  30.68 
 
 
344 aa  99  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  26.77 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  35.81 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  30.16 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  30.16 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
269 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  30.16 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
271 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  30.16 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 
291 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
268 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 
291 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 
276 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
276 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 
278 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.74 
 
 
267 aa  95.9  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  30.16 
 
 
291 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
342 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12080  short-chain alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
268 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.7 
 
 
270 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
279 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
247 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.14 
 
 
275 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
283 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  29.1 
 
 
291 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
276 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
273 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  30.77 
 
 
304 aa  92.4  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
279 aa  92.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
289 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>