86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30380 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  100 
 
 		 589 aa  1167    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  45.63 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  39.5 
 
 		 545 aa  263  8e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  38.02 
 
 		 541 aa  233  7.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  33.56 
 
 		 594 aa  199  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  36.29 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  35.92 
 
 		 479 aa  171  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  33.67 
 
 		 474 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  33.65 
 
 		 457 aa  159  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  32.32 
 
 		 547 aa  153  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  31.74 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  31.74 
 
 		 434 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  31.74 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  32.96 
 
 		 377 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  32.96 
 
 		 411 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  32.33 
 
 		 437 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  32.96 
 
 		 377 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  31.93 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  33.94 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  31.52 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  31.93 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  30.08 
 
 		 426 aa  143  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  32.21 
 
 		 405 aa  143  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  30 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  33.64 
 
 		 423 aa  141  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  31.46 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  31.83 
 
 		 430 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  31.71 
 
 		 404 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  31.33 
 
 		 424 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  30.92 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  31.09 
 
 		 408 aa  133  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  31.03 
 
 		 466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  30.91 
 
 		 410 aa  130  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  29.81 
 
 		 426 aa  128  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  31.06 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  30.53 
 
 		 404 aa  121  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  28.71 
 
 		 481 aa  121  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  34.07 
 
 		 256 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  32.52 
 
 		 268 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  28.31 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  30.5 
 
 		 510 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  26.55 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  25.47 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  26.48 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.53 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  25.39 
 
 		 580 aa  68.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  26.73 
 
 		 535 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  25.78 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  27.36 
 
 		 556 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  25.33 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  25.38 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  33.59 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  24.2 
 
 		 567 aa  60.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  24.4 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  29.73 
 
 		 602 aa  58.9  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 603 aa  57.8  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  23.95 
 
 		 567 aa  57  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  23.9 
 
 		 484 aa  57  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  24.29 
 
 		 585 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  27.32 
 
 		 443 aa  57  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  23.95 
 
 		 464 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  27.72 
 
 		 584 aa  53.9  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  26.85 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  29.45 
 
 		 628 aa  50.8  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  30.43 
 
 		 530 aa  50.8  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 315 aa  50.4  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  26.81 
 
 		 516 aa  50.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  25.57 
 
 		 432 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  37.37 
 
 		 535 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  34.09 
 
 		 565 aa  48.1  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  34.25 
 
 		 558 aa  47.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  34.78 
 
 		 581 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  34.78 
 
 		 581 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  27.07 
 
 		 498 aa  47.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  32.88 
 
 		 605 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  32.88 
 
 		 580 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  35.09 
 
 		 578 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  23.3 
 
 		 620 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  25.79 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  29 
 
 		 546 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  25.79 
 
 		 511 aa  45.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 748 aa  45.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  34 
 
 		 593 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  29.27 
 
 		 743 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  31.3 
 
 		 198 aa  43.9  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  33 
 
 		 601 aa  43.9  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>