108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02410 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  100 
 
 		 198 aa  396  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  58.65 
 
 		 565 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  65.24 
 
 		 169 aa  221  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  38.35 
 
 		 748 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  41.73 
 
 		 637 aa  88.2  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  36.36 
 
 		 484 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  40.56 
 
 		 567 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  35.8 
 
 		 530 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  39.86 
 
 		 582 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  50 
 
 		 491 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  50 
 
 		 491 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  50 
 
 		 491 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  50 
 
 		 516 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  48.94 
 
 		 508 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  48.94 
 
 		 508 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  50 
 
 		 514 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  50 
 
 		 508 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  50 
 
 		 508 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  33.81 
 
 		 567 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  34.53 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  46.07 
 
 		 512 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  43.82 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  38.51 
 
 		 532 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  37.68 
 
 		 620 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  34.73 
 
 		 628 aa  75.9  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  47.87 
 
 		 601 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  38.56 
 
 		 586 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  34.06 
 
 		 443 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  44.57 
 
 		 480 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  44.57 
 
 		 480 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  37.89 
 
 		 593 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  44.57 
 
 		 480 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  43.3 
 
 		 581 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  43.3 
 
 		 581 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  43.3 
 
 		 578 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  45.36 
 
 		 550 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  39.16 
 
 		 601 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  37.91 
 
 		 571 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  42.27 
 
 		 593 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  42.27 
 
 		 593 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  38.69 
 
 		 578 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  42.24 
 
 		 516 aa  72  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  43.62 
 
 		 519 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  41.24 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  41.24 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  41.57 
 
 		 539 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  40.86 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  41.94 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  39.33 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  39.33 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  32.28 
 
 		 714 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  41.94 
 
 		 519 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  40 
 
 		 535 aa  65.5  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  40.86 
 
 		 517 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  35.25 
 
 		 579 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  35.56 
 
 		 743 aa  64.7  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  28.66 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  43.53 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  35.1 
 
 		 709 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  34.86 
 
 		 551 aa  62  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  32.41 
 
 		 603 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  39.42 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  28.95 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  32.28 
 
 		 602 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  33.61 
 
 		 519 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  38.89 
 
 		 550 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  37.5 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  36.46 
 
 		 557 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28.99 
 
 		 556 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  37.63 
 
 		 516 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 561 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  32.84 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  36.46 
 
 		 602 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  30.68 
 
 		 566 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  26.56 
 
 		 620 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  34.48 
 
 		 473 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  33.58 
 
 		 553 aa  55.1  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 498 aa  54.7  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  28.75 
 
 		 499 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  33.62 
 
 		 577 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  25.78 
 
 		 585 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  27.34 
 
 		 566 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  26.56 
 
 		 568 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  34.62 
 
 		 521 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  26.47 
 
 		 507 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  36.36 
 
 		 546 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  31.53 
 
 		 502 aa  52  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  31.3 
 
 		 584 aa  51.6  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  26.12 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  32.26 
 
 		 523 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  29.57 
 
 		 580 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  30.43 
 
 		 580 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  38.3 
 
 		 635 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  30.28 
 
 		 558 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  26.12 
 
 		 508 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  31.3 
 
 		 535 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  29.37 
 
 		 427 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  32.12 
 
 		 464 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  31.58 
 
 		 554 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>