More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5114 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
413 aa  847  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  96.61 
 
 
413 aa  821  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.38182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  96.85 
 
 
414 aa  823  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  97.58 
 
 
413 aa  829  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  3.58223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  97.34 
 
 
413 aa  828  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  97.09 
 
 
414 aa  826  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  97.34 
 
 
414 aa  827  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  4.68931e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  94.92 
 
 
413 aa  808  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  97.09 
 
 
413 aa  824  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.15106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  97.09 
 
 
413 aa  825  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.29833e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  79.61 
 
 
412 aa  697  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  83.41 
 
 
411 aa  719  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.28494e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  96.85 
 
 
413 aa  825  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.94889e-09  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 
412 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 
412 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  69.59 
 
 
412 aa  594  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  68.78 
 
 
412 aa  592  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  69.27 
 
 
418 aa  589  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  69.54 
 
 
417 aa  589  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.0982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 
410 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  68.05 
 
 
415 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 
410 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  68.45 
 
 
415 aa  574  1e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  67.96 
 
 
415 aa  573  1e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 
415 aa  572  1e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.67671e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  66.75 
 
 
415 aa  569  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  67.07 
 
 
413 aa  569  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  66.5 
 
 
415 aa  567  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  66.1 
 
 
412 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 
415 aa  563  1e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  65.93 
 
 
420 aa  559  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  67.07 
 
 
414 aa  559  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 
413 aa  556  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  67.08 
 
 
412 aa  554  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  65.02 
 
 
416 aa  551  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 
416 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 
415 aa  546  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 
412 aa  545  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 
422 aa  541  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 
412 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 
412 aa  539  1e-152  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 
413 aa  538  1e-152  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  65.36 
 
 
413 aa  538  1e-152  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 
417 aa  536  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  63.92 
 
 
414 aa  537  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 
415 aa  537  1e-151  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 
431 aa  531  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 
424 aa  534  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  64.41 
 
 
415 aa  534  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 
420 aa  532  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 
439 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 
414 aa  526  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
429 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 
438 aa  527  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 
414 aa  527  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1035  Glycine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 
418 aa  525  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 
437 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 
427 aa  524  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  61.45 
 
 
438 aa  521  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 
411 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 
422 aa  519  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 
412 aa  518  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.62006e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 
423 aa  521  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  65.37 
 
 
412 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 
412 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 
419 aa  521  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.84892e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21550  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 
418 aa  514  1e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.968894  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 
417 aa  514  1e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
423 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 
423 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 
417 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 
466 aa  513  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14902e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 
417 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 
423 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
425 aa  512  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 
421 aa  510  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  58.15 
 
 
423 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 
412 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 
417 aa  511  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  59.52 
 
 
431 aa  510  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 
434 aa  508  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 
433 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  61.34 
 
 
427 aa  510  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
419 aa  508  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  61.34 
 
 
427 aa  509  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 
415 aa  505  1e-142  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 
427 aa  506  1e-142  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  6.92081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 
417 aa  508  1e-142  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 
422 aa  506  1e-142  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 
413 aa  508  1e-142  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.66706e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 
427 aa  507  1e-142  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  58.09 
 
 
418 aa  503  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3410  serine hydroxymethyltransferase  58.43 
 
 
424 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  60.3 
 
 
415 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 
436 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 
418 aa  504  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 
411 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
431 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  61.29 
 
 
415 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 
424 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>