More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1035 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21550  serine hydroxymethyltransferase  74.4 
 
 		 418 aa  639    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.968894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1035  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 418 aa  854    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314303 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12140  serine hydroxymethyltransferase  72.42 
 
 		 417 aa  609  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 413 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 413 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 414 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 414 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 411 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 413 aa  525  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 		 412 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 413 aa  524  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 410 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  62.13 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 413 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 414 aa  501  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  61.15 
 
 		 416 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 434 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 422 aa  497  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  63.96 
 
 		 427 aa  498  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 		 412 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  63.96 
 
 		 427 aa  497  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 		 412 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 		 413 aa  494  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  59.16 
 
 		 415 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 422 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 427 aa  492  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 423 aa  491  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  57.69 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 416 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 431 aa  488  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  58.58 
 
 		 421 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 434 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  56.35 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 419 aa  481  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 419 aa  481  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 412 aa  481  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 431 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 		 412 aa  481  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  59.46 
 
 		 414 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  58.72 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 508 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 415 aa  481  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 431 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 414 aa  481  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  57.42 
 
 		 438 aa  475  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 438 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 		 439 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  56.62 
 
 		 412 aa  475  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  59.62 
 
 		 451 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 411 aa  477  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>