More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4870 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  373  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  373  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
186 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  93.01 
 
 
212 aa  347  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  93.01 
 
 
186 aa  347  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  89.78 
 
 
212 aa  341  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  84.86 
 
 
211 aa  303  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  70.65 
 
 
212 aa  263  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  61.11 
 
 
213 aa  240  8e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  64.8 
 
 
212 aa  239  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  63.04 
 
 
214 aa  231  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  59.24 
 
 
210 aa  230  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  57.61 
 
 
210 aa  226  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  59.22 
 
 
179 aa  225  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  58.24 
 
 
209 aa  222  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  59.78 
 
 
219 aa  220  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  53.8 
 
 
222 aa  208  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  58.43 
 
 
219 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  58.43 
 
 
219 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  55.87 
 
 
204 aa  192  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  49.45 
 
 
220 aa  189  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.82515e-09 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  56.86 
 
 
162 aa  181  5e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  44.38 
 
 
214 aa  178  3e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 
207 aa  177  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 
193 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
215 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  47.28 
 
 
196 aa  175  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
227 aa  174  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
196 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  42.46 
 
 
198 aa  162  2e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  44.02 
 
 
193 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  48.85 
 
 
221 aa  151  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  42.46 
 
 
209 aa  130  8e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 
205 aa  130  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 
192 aa  130  1e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
191 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 
198 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
202 aa  118  5e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
202 aa  115  4e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
206 aa  111  7e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
190 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
206 aa  110  1e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
194 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
212 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  38.82 
 
 
209 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  37.43 
 
 
196 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
176 aa  105  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
200 aa  104  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
206 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
206 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
206 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
206 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
200 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  35.84 
 
 
196 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  36.31 
 
 
196 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 
206 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
194 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
197 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
211 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
212 aa  101  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
193 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
190 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  33.54 
 
 
199 aa  99  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  37.43 
 
 
194 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
199 aa  97.8  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 
199 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.15862e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  35.88 
 
 
200 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 
196 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
196 aa  92  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 
198 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
206 aa  91.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  3.6044e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 
209 aa  91.3  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 
222 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
247 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
200 aa  89.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47212e-06 
 
 
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NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
198 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
198 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
198 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
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