More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4931 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4931  porin  100 
 
 
357 aa  719  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  100 
 
 
357 aa  719  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  82.91 
 
 
357 aa  606  1e-172  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  83.47 
 
 
357 aa  602  1e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  83.47 
 
 
357 aa  602  1e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  50.16 
 
 
341 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  49.52 
 
 
340 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  40.66 
 
 
357 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  40.36 
 
 
357 aa  213  3e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  40 
 
 
356 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  39.63 
 
 
341 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  40.66 
 
 
351 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  39.39 
 
 
356 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  39.94 
 
 
352 aa  202  1e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  39.94 
 
 
352 aa  202  1e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  37.73 
 
 
363 aa  201  2e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  37.05 
 
 
361 aa  198  1e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  38.34 
 
 
340 aa  197  2e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  39.22 
 
 
358 aa  196  4e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  39.08 
 
 
362 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  40 
 
 
358 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  40 
 
 
387 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  38.81 
 
 
361 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  37.15 
 
 
359 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  39.7 
 
 
358 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  38.39 
 
 
361 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  38.51 
 
 
358 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  36.44 
 
 
367 aa  189  6e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  37.85 
 
 
342 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  41.61 
 
 
332 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  36.53 
 
 
344 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  38.21 
 
 
358 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  38.21 
 
 
358 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  38.21 
 
 
358 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  36.83 
 
 
344 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  38.21 
 
 
358 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  35.82 
 
 
344 aa  184  2e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  36.36 
 
 
360 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  37.91 
 
 
358 aa  182  9e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  37.61 
 
 
358 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  35.65 
 
 
365 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  29.73 
 
 
369 aa  119  1e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  3.49197e-07  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  32.39 
 
 
348 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  30.81 
 
 
338 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  4.23032e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  32.43 
 
 
384 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  32.43 
 
 
430 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  32.43 
 
 
430 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  31.76 
 
 
523 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  30.59 
 
 
344 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  32.13 
 
 
411 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  32.13 
 
 
384 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  32.13 
 
 
384 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  32.13 
 
 
384 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  29.94 
 
 
335 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  31.12 
 
 
352 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  32.87 
 
 
350 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  30.58 
 
 
360 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  33.6 
 
 
350 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  33.6 
 
 
350 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  31.76 
 
 
350 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  30.07 
 
 
348 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  33.33 
 
 
362 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  31.64 
 
 
390 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  32.47 
 
 
376 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  32.47 
 
 
376 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  33.33 
 
 
350 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  32.56 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2720  OmpC family outer membrane porin  28.99 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.43 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.43 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.43 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.43 
 
 
449 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.43 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1245  porin  31.8 
 
 
342 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240847  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.43 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  30.25 
 
 
383 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  30.66 
 
 
390 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  30.1 
 
 
357 aa  95.9  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  29.03 
 
 
360 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  31.37 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  37.16 
 
 
395 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  31.52 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  30.3 
 
 
430 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.13 
 
 
363 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  29.26 
 
 
386 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  29.62 
 
 
430 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  27.62 
 
 
436 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  29.67 
 
 
430 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  28.06 
 
 
356 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  28.42 
 
 
436 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  30.36 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  37.99 
 
 
404 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  29.17 
 
 
386 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  29.17 
 
 
386 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  29.37 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  29.17 
 
 
386 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  29.37 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  30.05 
 
 
384 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  39.43 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  30.03 
 
 
387 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>