More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0309 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  100 
 
 
427 aa  792  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  99.06 
 
 
427 aa  786  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.69004e-05  unclonable  5.14998e-11 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  100 
 
 
427 aa  792  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  3.78785e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  89.83 
 
 
431 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.5695e-06  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  85.75 
 
 
427 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  1.15228e-11 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0236  major facilitator transporter  92.42 
 
 
423 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00013187  hitchhiker  8.03869e-10 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0228  major facilitator transporter  91.92 
 
 
425 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000132249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  74.25 
 
 
422 aa  465  1e-130  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  66.26 
 
 
433 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3799  major facilitator transporter  73.21 
 
 
433 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  2.91886e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0028  MFS permease  72.97 
 
 
422 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  6.23855e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3860  major facilitator transporter  73.21 
 
 
442 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  53.98 
 
 
416 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  43.77 
 
 
393 aa  284  2e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  47.17 
 
 
402 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  47.27 
 
 
401 aa  263  5e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  46.11 
 
 
396 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  44.16 
 
 
404 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  47.41 
 
 
402 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  44.33 
 
 
398 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  42.54 
 
 
405 aa  254  2e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  42.86 
 
 
405 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  46 
 
 
406 aa  252  9e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  43.07 
 
 
405 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  44.3 
 
 
395 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  42.82 
 
 
405 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  42.82 
 
 
405 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  42.71 
 
 
404 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  40.94 
 
 
389 aa  246  5e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  40.94 
 
 
389 aa  246  5e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  42.3 
 
 
407 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  42.6 
 
 
400 aa  239  6e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  42.09 
 
 
400 aa  239  6e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  42.6 
 
 
400 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  39.85 
 
 
405 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  45.97 
 
 
413 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  49.48 
 
 
408 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 
447 aa  225  9e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 
388 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  46.5 
 
 
419 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  42.13 
 
 
398 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 
419 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  41.95 
 
 
398 aa  219  9e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  37.87 
 
 
399 aa  216  6e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  37.87 
 
 
399 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  45.99 
 
 
401 aa  215  1e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  36.51 
 
 
394 aa  214  3e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 
397 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  38.21 
 
 
385 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  38.86 
 
 
399 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  38.17 
 
 
399 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  40.15 
 
 
405 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  40.53 
 
 
389 aa  196  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  38.52 
 
 
411 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  3.83306e-07 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  40.26 
 
 
415 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  37.72 
 
 
395 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  44 
 
 
399 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  35.58 
 
 
403 aa  192  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  44.42 
 
 
399 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  42.89 
 
 
399 aa  191  3e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  32.31 
 
 
406 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  32.31 
 
 
406 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  45.17 
 
 
402 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  32.31 
 
 
403 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.58101e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  41.01 
 
 
400 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
403 aa  186  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 
415 aa  185  1e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 
387 aa  185  1e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  31.02 
 
 
392 aa  184  2e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  38.26 
 
 
394 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 
399 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  38.26 
 
 
394 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 
410 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  38.26 
 
 
394 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  33.99 
 
 
426 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  38.26 
 
 
394 aa  183  5e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  37.99 
 
 
394 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  45.76 
 
 
409 aa  180  3e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  40.36 
 
 
405 aa  180  5e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  34.38 
 
 
399 aa  180  5e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  37.37 
 
 
394 aa  180  5e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  37.99 
 
 
394 aa  179  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
389 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  34.38 
 
 
399 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  38.56 
 
 
399 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  34.38 
 
 
399 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  38.17 
 
 
399 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.2 
 
 
400 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.22 
 
 
383 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
413 aa  175  2e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 
406 aa  174  2e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  34.58 
 
 
407 aa  174  2e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  39.74 
 
 
403 aa  174  2e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  36.62 
 
 
404 aa  174  2e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  39.79 
 
 
399 aa  174  3e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  37.82 
 
 
394 aa  173  6e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  37.82 
 
 
394 aa  173  7e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  37.82 
 
 
394 aa  172  7e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  37.82 
 
 
394 aa  172  7e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  37.99 
 
 
394 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>