More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03770 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  100 
 
 
401 aa  763    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  63.54 
 
 
395 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  64.1 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  63.83 
 
 
398 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  59.64 
 
 
405 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  58.85 
 
 
405 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  59.38 
 
 
405 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  59.64 
 
 
405 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  59.64 
 
 
405 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  61.62 
 
 
405 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  58.81 
 
 
404 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  59.54 
 
 
404 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  59.74 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  59.74 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  59.74 
 
 
400 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  65.01 
 
 
399 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  64.68 
 
 
399 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  65.18 
 
 
399 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  64.16 
 
 
399 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  60.17 
 
 
388 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  59.69 
 
 
400 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  65.01 
 
 
402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  51.31 
 
 
393 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  49.38 
 
 
407 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  49.07 
 
 
396 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  51.68 
 
 
402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  46.23 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  46.23 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  51.12 
 
 
401 aa  305  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  49.37 
 
 
406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  48.21 
 
 
398 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  52.63 
 
 
413 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  51.8 
 
 
402 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  47.03 
 
 
405 aa  282  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 
447 aa  266  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  42.86 
 
 
399 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  44.68 
 
 
399 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  42.6 
 
 
399 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  42.86 
 
 
399 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  42.26 
 
 
385 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  51.61 
 
 
409 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  36.05 
 
 
392 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  35.73 
 
 
406 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  35.73 
 
 
406 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  35.73 
 
 
403 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  39.89 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  42.93 
 
 
416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  48.5 
 
 
408 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  49.59 
 
 
413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  40.4 
 
 
399 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  40.4 
 
 
399 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  40.4 
 
 
399 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  37.12 
 
 
403 aa  230  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  40.94 
 
 
395 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  43.13 
 
 
433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 
399 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.21 
 
 
405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 
415 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  42.82 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  37.24 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  42.49 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.52 
 
 
406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 
413 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  40.8 
 
 
394 aa  212  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 
406 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  40.35 
 
 
394 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  39.69 
 
 
404 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 
389 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  38.73 
 
 
403 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  40.46 
 
 
403 aa  209  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  41.01 
 
 
394 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  39.02 
 
 
400 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  35.77 
 
 
383 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 
410 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 
403 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  38.86 
 
 
411 aa  209  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  40.1 
 
 
394 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  44.88 
 
 
427 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  40.1 
 
 
394 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  41.37 
 
 
389 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  40.1 
 
 
394 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
397 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  40.1 
 
 
394 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  38.57 
 
 
403 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
394 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  40.62 
 
 
399 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  40.85 
 
 
394 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  40.98 
 
 
399 aa  205  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  40.62 
 
 
399 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  40.62 
 
 
399 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  40.51 
 
 
394 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  40.62 
 
 
399 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  40.51 
 
 
394 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  40.62 
 
 
405 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  40.62 
 
 
399 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  40.51 
 
 
394 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  40.62 
 
 
399 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  38.25 
 
 
394 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  40.1 
 
 
394 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  43.77 
 
 
412 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>