More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1242 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  100 
 
 
433 aa  829    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  68.09 
 
 
422 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  65.27 
 
 
431 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  66.08 
 
 
427 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  68.87 
 
 
427 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  66.67 
 
 
427 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  66.67 
 
 
427 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000378785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0028  MFS permease  71.43 
 
 
422 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000623855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3860  major facilitator transporter  68.26 
 
 
442 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3799  major facilitator transporter  68.26 
 
 
433 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000291886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0236  major facilitator transporter  68.6 
 
 
423 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00013187  hitchhiker  0.000000000803869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0228  major facilitator transporter  68.34 
 
 
425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000132249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  53.98 
 
 
416 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  41.43 
 
 
393 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  42.02 
 
 
389 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  42.02 
 
 
389 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  45.72 
 
 
401 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  42.71 
 
 
398 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  47.07 
 
 
402 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  46.87 
 
 
402 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  42.6 
 
 
396 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  40.81 
 
 
399 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  40.81 
 
 
399 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  41.32 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  40.25 
 
 
405 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  40.77 
 
 
404 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  40.2 
 
 
405 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  47.26 
 
 
408 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  41.19 
 
 
385 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.18 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  46.98 
 
 
419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  42.14 
 
 
447 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  41.62 
 
 
395 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.8 
 
 
405 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  39.8 
 
 
405 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.8 
 
 
405 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  45.94 
 
 
419 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  40.78 
 
 
399 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  38.95 
 
 
405 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  40.26 
 
 
398 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  42.78 
 
 
406 aa  229  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
388 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  40.05 
 
 
398 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  39.9 
 
 
407 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  40.47 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  43.1 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  40.47 
 
 
400 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40.47 
 
 
400 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.94 
 
 
383 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  35.82 
 
 
394 aa  217  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.46 
 
 
399 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.46 
 
 
399 aa  206  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.46 
 
 
399 aa  206  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  38.11 
 
 
394 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 
397 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  43.06 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 
406 aa  200  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 
387 aa  199  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 
406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  37.1 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  36.34 
 
 
395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  37.24 
 
 
394 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  34.55 
 
 
403 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  37.24 
 
 
394 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  37.24 
 
 
394 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  37.24 
 
 
394 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  37.24 
 
 
394 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  37.5 
 
 
394 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  38.02 
 
 
394 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  39.38 
 
 
399 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  38.22 
 
 
394 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  38.22 
 
 
394 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  38.22 
 
 
394 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  37.96 
 
 
394 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  41.02 
 
 
405 aa  186  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  38.54 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  39.53 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  39.53 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  39.27 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  39.53 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  39.53 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  39.53 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 
410 aa  183  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  39.89 
 
 
400 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.71 
 
 
400 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  34.7 
 
 
426 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  36.34 
 
 
405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  34.36 
 
 
390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
399 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  34.27 
 
 
407 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  34.46 
 
 
411 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  36.02 
 
 
404 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  37.77 
 
 
389 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 
399 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 
403 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 
389 aa  176  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  30.11 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  32.04 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  32.04 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>