291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3860 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0028  MFS permease  99.76 
 
 
422 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000623855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3799  major facilitator transporter  99.77 
 
 
433 aa  805    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000291886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3860  major facilitator transporter  100 
 
 
442 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  91.71 
 
 
422 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  74.51 
 
 
427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  68.26 
 
 
433 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  72.33 
 
 
431 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  74.5 
 
 
427 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  74.5 
 
 
427 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000378785  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  74.12 
 
 
427 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0236  major facilitator transporter  75.88 
 
 
423 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00013187  hitchhiker  0.000000000803869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0228  major facilitator transporter  75.13 
 
 
425 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000132249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  51.24 
 
 
416 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  41.48 
 
 
393 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  45.54 
 
 
402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  44.05 
 
 
406 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 
402 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  44.47 
 
 
401 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  40.9 
 
 
407 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  38.58 
 
 
389 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  38.58 
 
 
389 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  43.09 
 
 
398 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  41.25 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  42.55 
 
 
396 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  41.1 
 
 
405 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  40.74 
 
 
398 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  42.18 
 
 
405 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  41.09 
 
 
395 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  41.91 
 
 
405 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  41.91 
 
 
405 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  42.54 
 
 
413 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  40.77 
 
 
398 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  40.98 
 
 
404 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  41.73 
 
 
404 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  45.73 
 
 
419 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  39.52 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40 
 
 
400 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  40 
 
 
400 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  40 
 
 
400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  45.43 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
447 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 
388 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  33.77 
 
 
394 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  36.59 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  36.59 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  37.9 
 
 
399 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
397 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  39.8 
 
 
405 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 
399 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  42.13 
 
 
401 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  40.98 
 
 
400 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 
403 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  34.5 
 
 
394 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  36.78 
 
 
385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.78 
 
 
411 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  34.79 
 
 
403 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  35.64 
 
 
399 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  35 
 
 
394 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  35 
 
 
394 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  35 
 
 
394 aa  187  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  35 
 
 
394 aa  187  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  36.96 
 
 
404 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  35 
 
 
394 aa  186  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  34.45 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  34.45 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  34.45 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  34.5 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  37.63 
 
 
400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  38.62 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  29.82 
 
 
392 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  37.62 
 
 
399 aa  183  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  35 
 
 
394 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  35 
 
 
394 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  35 
 
 
394 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  35 
 
 
394 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  35 
 
 
394 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  35.73 
 
 
395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  38.32 
 
 
415 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  30.79 
 
 
406 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  30.79 
 
 
406 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
415 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  31.39 
 
 
403 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  33.33 
 
 
415 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  41.36 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
394 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  37.98 
 
 
405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  41.99 
 
 
399 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  36.9 
 
 
429 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  40.47 
 
 
399 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  36.9 
 
 
429 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 
406 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  40.47 
 
 
399 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
410 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  38.52 
 
 
398 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  38.26 
 
 
398 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  38.52 
 
 
398 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  38.52 
 
 
398 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  38.52 
 
 
398 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  43.9 
 
 
409 aa  170  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>