More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0010 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  98.61 
 
 
361 aa  719    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  93.52 
 
 
364 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  90.91 
 
 
363 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  100 
 
 
361 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  90.91 
 
 
363 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  100 
 
 
361 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  80.33 
 
 
361 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  87.97 
 
 
363 aa  597  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  79.5 
 
 
361 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  79.22 
 
 
361 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  79.22 
 
 
361 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  63.46 
 
 
364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  54.78 
 
 
363 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  55.69 
 
 
362 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  54.71 
 
 
350 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  53.8 
 
 
350 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  52.19 
 
 
350 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  50.29 
 
 
348 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  50.58 
 
 
370 aa  335  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  50.91 
 
 
366 aa  328  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  49.13 
 
 
357 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  49.45 
 
 
370 aa  323  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  50.79 
 
 
353 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  48.25 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  43.5 
 
 
367 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  45.66 
 
 
368 aa  298  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  47.11 
 
 
353 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  46.99 
 
 
372 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  44.28 
 
 
363 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  42.61 
 
 
361 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  43.12 
 
 
365 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  43.25 
 
 
351 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  40.79 
 
 
365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  42.05 
 
 
335 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  41.43 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  37.82 
 
 
329 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  40 
 
 
353 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  37.34 
 
 
338 aa  202  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  37.06 
 
 
329 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  38.28 
 
 
330 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  37.58 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  37.05 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  36.93 
 
 
330 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  37.81 
 
 
328 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  34.11 
 
 
332 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  35.55 
 
 
326 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  34.88 
 
 
329 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  34.51 
 
 
331 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  34.97 
 
 
334 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  29.28 
 
 
331 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  33.68 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  32.52 
 
 
332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  33.1 
 
 
332 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  31.21 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  32.15 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  33.52 
 
 
345 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  32.41 
 
 
335 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  32.29 
 
 
332 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  30.36 
 
 
335 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  32.07 
 
 
335 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  32.07 
 
 
335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  32.07 
 
 
335 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  29.74 
 
 
303 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  27.47 
 
 
529 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  27.78 
 
 
529 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  28.86 
 
 
675 aa  99.4  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1244  Catalase  29.25 
 
 
487 aa  99.4  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  29.14 
 
 
705 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  28.28 
 
 
695 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  27.3 
 
 
552 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  29.14 
 
 
704 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  29.77 
 
 
801 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  28.92 
 
 
693 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  29.67 
 
 
702 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  26.83 
 
 
529 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  27.27 
 
 
695 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  29.67 
 
 
702 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  28.09 
 
 
724 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  29.45 
 
 
493 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  28.24 
 
 
848 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4790  catalase  28.76 
 
 
704 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  27.27 
 
 
695 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  27.46 
 
 
459 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  26.43 
 
 
552 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  28.76 
 
 
705 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  27.42 
 
 
458 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  26.94 
 
 
458 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  27.12 
 
 
459 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  28.31 
 
 
543 aa  93.2  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  26.52 
 
 
529 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  26.52 
 
 
530 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  26.94 
 
 
459 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  27.52 
 
 
700 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  26.52 
 
 
530 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  26.94 
 
 
459 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  27.3 
 
 
459 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  29.47 
 
 
516 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  29.47 
 
 
511 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  29.47 
 
 
511 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  29.47 
 
 
505 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>