More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3694 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
494 aa  980  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  92.31 
 
 
494 aa  898  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  69.39 
 
 
493 aa  636  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  91.5 
 
 
494 aa  892  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  88.77 
 
 
495 aa  837  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  91.5 
 
 
494 aa  892  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  91.7 
 
 
494 aa  893  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  97.77 
 
 
509 aa  960  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  69.18 
 
 
493 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  69.06 
 
 
574 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  69.18 
 
 
570 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  63.43 
 
 
490 aa  626  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  64.12 
 
 
490 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  63.02 
 
 
489 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  62.94 
 
 
485 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  61.52 
 
 
485 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  60.13 
 
 
504 aa  581  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  58.56 
 
 
504 aa  563  1e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  52.59 
 
 
473 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.29974e-15 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  52.88 
 
 
476 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
478 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  51.65 
 
 
475 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  49.37 
 
 
477 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  49.16 
 
 
498 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  48.95 
 
 
502 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  47.84 
 
 
491 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.07 
 
 
488 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.91 
 
 
488 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  47.33 
 
 
488 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
477 aa  328  1e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
517 aa  310  3e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  6.15538e-06  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
490 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  38.71 
 
 
508 aa  308  1e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  2.08159e-08  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
496 aa  306  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  37.73 
 
 
509 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
509 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 
509 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  7.22465e-07 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 
492 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
496 aa  293  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  38.88 
 
 
490 aa  293  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
492 aa  293  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  42.55 
 
 
481 aa  292  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
501 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  40.5 
 
 
510 aa  290  5e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  36.97 
 
 
475 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
503 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.6 
 
 
472 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
487 aa  286  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 
520 aa  285  1e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  36.76 
 
 
501 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.89 
 
 
500 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.76 
 
 
471 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
475 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
569 aa  277  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
501 aa  277  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
493 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
501 aa  276  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
485 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.14 
 
 
485 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  36 
 
 
520 aa  276  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  1.52055e-05  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  38.19 
 
 
508 aa  275  1e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  39.67 
 
 
506 aa  274  2e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  35 
 
 
485 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 
496 aa  273  4e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.37 
 
 
497 aa  273  4e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
491 aa  273  5e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  35.7 
 
 
504 aa  273  5e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.58 
 
 
497 aa  273  5e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.79 
 
 
495 aa  273  6e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 
470 aa  273  8e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
486 aa  272  8e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.79 
 
 
464 aa  272  9e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.58 
 
 
471 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
485 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.75 
 
 
496 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
493 aa  270  3e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  39.5 
 
 
520 aa  271  3e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
516 aa  270  3e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
488 aa  271  3e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 
464 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.42 
 
 
503 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
485 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.45 
 
 
499 aa  270  6e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  40 
 
 
516 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.02 
 
 
472 aa  269  8e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
492 aa  269  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.76 
 
 
502 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
502 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
473 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
502 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
492 aa  267  3e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  39.84 
 
 
515 aa  267  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
493 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.92 
 
 
499 aa  266  9e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2017  transcriptional regulator  35.59 
 
 
505 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.70352  normal  0.217844 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.62 
 
 
503 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  35.85 
 
 
476 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  35.33 
 
 
504 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  40.04 
 
 
502 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  32.1 
 
 
467 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>