More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2216 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  91.95 
 
 		 410 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  90.73 
 
 		 410 aa  702    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  91.71 
 
 		 410 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  89.51 
 
 		 410 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  788    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  97.32 
 
 		 410 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  91.71 
 
 		 410 aa  683    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  62.72 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  62.97 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  61.08 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  49.61 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  52.06 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  51.41 
 
 		 407 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  48.77 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  51.42 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  48.63 
 
 		 413 aa  360  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  48.71 
 
 		 412 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 410 aa  355  7.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  49.11 
 
 		 407 aa  352  7e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  48.83 
 
 		 408 aa  352  8.999999999999999e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  48.13 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  48.06 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  50.39 
 
 		 430 aa  342  5.999999999999999e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 402 aa  339  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  50.13 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  45.48 
 
 		 414 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  46.63 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 		 408 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  46.82 
 
 		 405 aa  325  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  48.16 
 
 		 401 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 402 aa  323  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 		 408 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 404 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  48.1 
 
 		 410 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  50.39 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  47.59 
 
 		 400 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  47.14 
 
 		 528 aa  312  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  40.16 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  49.24 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  46.55 
 
 		 409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 409 aa  310  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 416 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 436 aa  306  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 406 aa  305  7e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 412 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  43 
 
 		 411 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  48.27 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  44.86 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  44.86 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  44.86 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  44.86 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  44.86 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  44.86 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  45.6 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  39.17 
 
 		 421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 412 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 414 aa  249  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 403 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  36.61 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 415 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  39.63 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  36.75 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 427 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 422 aa  144  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 433 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 405 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 428 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 452 aa  123  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  27.88 
 
 		 430 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  28.88 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.05 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 438 aa  116  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.01 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>