144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0377 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  99.23 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  95 
 
 		 260 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  93.46 
 
 		 260 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  93.46 
 
 		 260 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  93.85 
 
 		 260 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  93.46 
 
 		 260 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  88.51 
 
 		 261 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  88.51 
 
 		 261 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  88.51 
 
 		 261 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  81.99 
 
 		 260 aa  447  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  89.55 
 
 		 220 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  69.23 
 
 		 263 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  54.62 
 
 		 257 aa  296  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  54.66 
 
 		 262 aa  258  8e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  38.7 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  37.39 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  36.48 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  36.48 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  36.96 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  36.54 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  34.29 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  26.54 
 
 		 429 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  32.9 
 
 		 453 aa  92  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  31.79 
 
 		 449 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  31.79 
 
 		 449 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  30.73 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  29.27 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.43 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  29.63 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  30.41 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  29.61 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  30.38 
 
 		 430 aa  78.6  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  29.06 
 
 		 289 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  31.4 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  29.06 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  29.29 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  31.4 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  31.4 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  31.4 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  31.4 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  31.4 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  31.4 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  31.4 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  26.34 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  30.11 
 
 		 440 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  26.96 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  29.38 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3165  hypothetical protein  30.61 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1204  type IV / VI secretion system protein, DotU family  34.43 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  34.43 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  23.98 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  26.9 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  25.67 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  31.52 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  31.52 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  31.52 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  27.8 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  30.91 
 
 		 434 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  35.59 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  29.81 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  25 
 
 		 460 aa  65.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.22 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  26.06 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  35.11 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  31.61 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  28.74 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  27.91 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  31.61 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  27.91 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  27.91 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  27.91 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  27.91 
 
 		 421 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  27.91 
 
 		 421 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  27.91 
 
 		 421 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  24.32 
 
 		 494 aa  62  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  30.07 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  25.63 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  24.56 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  25.9 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  23.74 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  24.08 
 
 		 443 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  25.2 
 
 		 469 aa  58.9  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.05 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  26.14 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  24.55 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  30.81 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  25.58 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0164  hypothetical protein  40.86 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.431152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  20.85 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  25.23 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  41.67 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  30.97 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  27.08 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  25.3 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  30.97 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  20.43 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  26.19 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.38 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>