More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2324 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  65.55 
 
 
846 aa  911    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  72.19 
 
 
732 aa  954    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  79.05 
 
 
888 aa  1099    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  78.99 
 
 
858 aa  1107    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  91.65 
 
 
839 aa  1396    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  68.24 
 
 
846 aa  899    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  91.77 
 
 
844 aa  1368    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  73.31 
 
 
698 aa  981    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  69.39 
 
 
850 aa  1009    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  70.43 
 
 
821 aa  1052    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  61.54 
 
 
686 aa  812    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  91.77 
 
 
928 aa  1370    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  91.77 
 
 
844 aa  1368    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  69.07 
 
 
834 aa  1050    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  70.65 
 
 
742 aa  962    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  78.7 
 
 
862 aa  1105    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
787 aa  1583    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  91.77 
 
 
844 aa  1368    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  91.77 
 
 
844 aa  1368    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  61.3 
 
 
678 aa  790    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  91.77 
 
 
839 aa  1369    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  61.6 
 
 
675 aa  798    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  65.12 
 
 
801 aa  892    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  74.46 
 
 
838 aa  1059    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  66.13 
 
 
846 aa  917    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  72.5 
 
 
787 aa  959    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  72.65 
 
 
826 aa  1017    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  78.41 
 
 
857 aa  1103    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  71.43 
 
 
743 aa  978    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  75.14 
 
 
857 aa  1108    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  65.05 
 
 
810 aa  886    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  65.24 
 
 
841 aa  903    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  78.51 
 
 
870 aa  1100    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  70.31 
 
 
728 aa  950    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  75.14 
 
 
857 aa  1108    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  71.43 
 
 
743 aa  978    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  71.43 
 
 
743 aa  976    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  50.31 
 
 
783 aa  598  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  39.49 
 
 
743 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  39.08 
 
 
750 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  39.81 
 
 
730 aa  428  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  37.46 
 
 
850 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  38.39 
 
 
774 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  39.23 
 
 
760 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  36.12 
 
 
815 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  35.64 
 
 
762 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  38.5 
 
 
752 aa  415  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  37.09 
 
 
762 aa  415  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  38.24 
 
 
755 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  37.37 
 
 
854 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  35.98 
 
 
786 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  35.81 
 
 
794 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  37.55 
 
 
772 aa  393  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  36.46 
 
 
767 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.93 
 
 
786 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  35.65 
 
 
759 aa  389  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
768 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  36.13 
 
 
740 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  36.39 
 
 
765 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  34.57 
 
 
785 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  35.16 
 
 
773 aa  362  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  34.38 
 
 
907 aa  357  2.9999999999999997e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  33.59 
 
 
776 aa  351  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.78 
 
 
646 aa  302  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  32.86 
 
 
817 aa  300  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  32.99 
 
 
791 aa  299  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  33.24 
 
 
771 aa  297  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  32.95 
 
 
792 aa  296  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  31.62 
 
 
795 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.6 
 
 
648 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.65 
 
 
661 aa  291  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  34.03 
 
 
811 aa  290  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.86 
 
 
679 aa  288  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  31.9 
 
 
748 aa  286  9e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  32.37 
 
 
793 aa  284  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  32.64 
 
 
790 aa  283  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  34.48 
 
 
683 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.4 
 
 
648 aa  281  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  35.02 
 
 
824 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  30.32 
 
 
791 aa  281  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  34.47 
 
 
707 aa  280  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  34.75 
 
 
776 aa  279  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  34.77 
 
 
709 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  34.77 
 
 
709 aa  277  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  34.77 
 
 
709 aa  277  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.18 
 
 
640 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  29.8 
 
 
817 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  32.68 
 
 
803 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.14 
 
 
761 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  29.67 
 
 
794 aa  273  7e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 
714 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  33.98 
 
 
773 aa  272  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  34.62 
 
 
705 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.23 
 
 
626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  29.12 
 
 
794 aa  271  5e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  32.11 
 
 
687 aa  270  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.87 
 
 
761 aa  270  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  34.17 
 
 
713 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  34.17 
 
 
713 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  34.17 
 
 
713 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>