More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3120 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  100 
 
 
422 aa  788  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0028  MFS permease  91.71 
 
 
422 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  6.23855e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3799  major facilitator transporter  91.71 
 
 
433 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  2.91886e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3860  major facilitator transporter  91.71 
 
 
442 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  73.77 
 
 
427 aa  446  1e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  1.15228e-11 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  71.84 
 
 
431 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.5695e-06  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  67.22 
 
 
433 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  74.12 
 
 
427 aa  415  1e-115  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.69004e-05  unclonable  5.14998e-11 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  74.25 
 
 
427 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  74.25 
 
 
427 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  3.78785e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0236  major facilitator transporter  75.13 
 
 
423 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00013187  hitchhiker  8.03869e-10 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0228  major facilitator transporter  74.87 
 
 
425 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000132249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  50.72 
 
 
416 aa  339  6e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  40.66 
 
 
393 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 
402 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  44.61 
 
 
406 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  42.04 
 
 
407 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  45.25 
 
 
402 aa  239  6e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  43.96 
 
 
401 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  42.13 
 
 
396 aa  236  5e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  39.11 
 
 
389 aa  236  5e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  39.11 
 
 
389 aa  236  5e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  42.16 
 
 
404 aa  235  1e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  41.45 
 
 
398 aa  235  1e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  44.27 
 
 
413 aa  234  2e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  41.54 
 
 
405 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  44.66 
 
 
419 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  41.51 
 
 
405 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  41.5 
 
 
404 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  40.26 
 
 
398 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  41.61 
 
 
405 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  40.86 
 
 
400 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  41.46 
 
 
405 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40.86 
 
 
400 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  41.46 
 
 
405 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  40.86 
 
 
400 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
419 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  40.85 
 
 
405 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  39.64 
 
 
398 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  40.31 
 
 
395 aa  219  8e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 
447 aa  214  3e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  45.48 
 
 
408 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 
388 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  37.71 
 
 
399 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  37.71 
 
 
399 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 
397 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  33.42 
 
 
394 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  37.16 
 
 
399 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  39.95 
 
 
405 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  37.23 
 
 
399 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  41.23 
 
 
401 aa  190  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  37.69 
 
 
385 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  38.97 
 
 
400 aa  189  6e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.84 
 
 
411 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  3.83306e-07 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  33.5 
 
 
403 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  36.23 
 
 
395 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 
399 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  36.41 
 
 
404 aa  185  1e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  38.46 
 
 
389 aa  184  2e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  35.23 
 
 
399 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  35.23 
 
 
399 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  35.23 
 
 
399 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
403 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  42.17 
 
 
399 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  29.24 
 
 
392 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  34.85 
 
 
394 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  34.75 
 
 
394 aa  181  3e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  34.75 
 
 
394 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  34.75 
 
 
394 aa  180  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  33.73 
 
 
415 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  34.75 
 
 
394 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
415 aa  179  6e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  34.75 
 
 
394 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  36.02 
 
 
400 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  39.61 
 
 
399 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  35.94 
 
 
399 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  34 
 
 
394 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  39.37 
 
 
399 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  39.29 
 
 
405 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  30.52 
 
 
406 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  37.84 
 
 
415 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  30.52 
 
 
406 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  34.25 
 
 
394 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  31.11 
 
 
403 aa  176  1e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.58101e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  34.25 
 
 
394 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  41.99 
 
 
402 aa  175  2e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  34.25 
 
 
394 aa  175  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  34.25 
 
 
394 aa  175  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  34.25 
 
 
394 aa  174  3e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 
394 aa  172  8e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
387 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  35.01 
 
 
383 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  40.05 
 
 
412 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  40.05 
 
 
412 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
410 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  40.05 
 
 
412 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  38.36 
 
 
399 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  39.25 
 
 
410 aa  165  1e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  37.25 
 
 
394 aa  165  1e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  42.93 
 
 
409 aa  165  1e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>