More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0655 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 444 aa  910    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  99.32 
 
 		 444 aa  902    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  80.18 
 
 		 444 aa  752    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  46.21 
 
 		 480 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  44.84 
 
 		 449 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  45.74 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  46.1 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  44.57 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  44.62 
 
 		 449 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  45.29 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  43.36 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.54 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.43 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.39 
 
 		 467 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 		 450 aa  362  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  43.98 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  45.18 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 		 450 aa  358  8e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.37 
 
 		 490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.71 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  42 
 
 		 489 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 		 452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  41.61 
 
 		 494 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 		 452 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.79 
 
 		 457 aa  325  9e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  43.82 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  36.81 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  40.96 
 
 		 494 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  40.96 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 451 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  40.73 
 
 		 457 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  40.73 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  40.73 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  40.73 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.94 
 
 		 456 aa  322  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  39.81 
 
 		 452 aa  322  6e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  40.4 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.59 
 
 		 454 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  41.18 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 		 455 aa  318  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  40.95 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  41.59 
 
 		 510 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  37.97 
 
 		 480 aa  317  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  39.59 
 
 		 446 aa  316  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 462 aa  316  5e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  39.12 
 
 		 450 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  40.85 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  37.44 
 
 		 451 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 		 458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  40.5 
 
 		 460 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  37.01 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 		 458 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  37.24 
 
 		 446 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  38.2 
 
 		 469 aa  312  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 		 460 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  37.15 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.68 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0090  coproporphyrinogen III oxidase  38.22 
 
 		 446 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  37.24 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  37.24 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  37.99 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  37.24 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  38.39 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  37.24 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  38.39 
 
 		 446 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  38.39 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  39.64 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  37.93 
 
 		 446 aa  309  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  36.02 
 
 		 455 aa  309  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.53 
 
 		 460 aa  309  5e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  40.5 
 
 		 461 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  40.79 
 
 		 470 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  37.44 
 
 		 463 aa  309  6.999999999999999e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 		 470 aa  309  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.79 
 
 		 458 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  36.96 
 
 		 451 aa  309  8e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  39.64 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2569  coproporphyrinogen III oxidase  41.11 
 
 		 449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  38.35 
 
 		 451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0053  coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59946  normal  0.060899 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  39.36 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.36 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  39.36 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0233  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.891625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  39.36 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  39.36 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  39.36 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  39.36 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  39.36 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  36.96 
 
 		 451 aa  307  3e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  38.88 
 
 		 460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.31 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  40.7 
 
 		 500 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 		 457 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 		 457 aa  306  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 		 457 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>