More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3255 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  100 
 
 		 413 aa  843    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  51.21 
 
 		 417 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  51.21 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.88 
 
 		 418 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 237 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 245 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 238 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 244 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 232 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  30.34 
 
 		 233 aa  94.4  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 		 235 aa  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  29.65 
 
 		 243 aa  87  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 237 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 235 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 235 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  28.45 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  29.24 
 
 		 235 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  29.22 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  28.21 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  28.51 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  28.09 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  28.09 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  28.09 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  28.09 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  28.09 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  30.6 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  28.09 
 
 		 234 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  23.89 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.76 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3557  short chain dehydrogenase  29.65 
 
 		 277 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.4 
 
 		 247 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3850  short chain dehydrogenase  29.59 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  28.02 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  28.36 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  28.65 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  28.51 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  27.24 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  26.72 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1977  short chain dehydrogenase  29.27 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  30.15 
 
 		 277 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 258 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1902  short chain dehydrogenase  29.27 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 		 295 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.41 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  27.16 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  24.89 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  29.23 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  24.89 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  24.89 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  27.85 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2528  short chain dehydrogenase  28.65 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.589688 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  26.96 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  25.32 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  27.63 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.566355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.54 
 
 		 257 aa  62.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.69 
 
 		 247 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 248 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1005  short chain dehydrogenase  26.83 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.47 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 279 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  26.94 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3172  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.1 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00470  acylglycerone-phosphate reductase, putative  31.08 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  26.99 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>