More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2053 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  100 
 
 		 303 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.88 
 
 		 303 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.43 
 
 		 303 aa  441  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.57 
 
 		 304 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.85 
 
 		 302 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.42 
 
 		 303 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  67.56 
 
 		 300 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  68.93 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.93 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.72 
 
 		 296 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  63.82 
 
 		 304 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  67.48 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  65.26 
 
 		 308 aa  364  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.43 
 
 		 300 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.61 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.57 
 
 		 311 aa  360  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.753458  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.21 
 
 		 308 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.88 
 
 		 302 aa  358  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.0471149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3905  dipeptide transporter  63.51 
 
 		 299 aa  355  5.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0046  dipeptide transporter  61.82 
 
 		 300 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4240  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.09 
 
 		 303 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4096  dipeptide transporter  61.67 
 
 		 300 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4563  dipeptide ABC transporter, permease protein  63.76 
 
 		 303 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.61 
 
 		 296 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.05 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.91 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.706102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.56 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.979311  normal  0.485884 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  62.86 
 
 		 302 aa  348  7e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5118  ABC transporter permease  63.51 
 
 		 303 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.5 
 
 		 302 aa  346  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58450  ABC transporter permease  63.18 
 
 		 303 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  58.31 
 
 		 301 aa  344  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0140  dipeptide transporter  63.18 
 
 		 300 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1584  dipeptide ABC transporter, permease protein  61.79 
 
 		 293 aa  338  8e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.34 
 
 		 305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.5 
 
 		 305 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.34 
 
 		 305 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.380903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.34 
 
 		 305 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.34 
 
 		 305 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.41 
 
 		 305 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0184  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  62.14 
 
 		 305 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3840  dipeptide transporter  63.32 
 
 		 300 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3948  dipeptide transporter  63.32 
 
 		 300 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4008  dipeptide transporter  63.32 
 
 		 300 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.912863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3904  dipeptide transporter  63.32 
 
 		 300 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3826  dipeptide transporter  63.32 
 
 		 300 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0186  dipeptide transporter  62.98 
 
 		 300 aa  328  9e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0051  dipeptide transporter  61.49 
 
 		 300 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.644242  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.34 
 
 		 305 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.68 
 
 		 305 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4073  dipeptide transporter  61.59 
 
 		 300 aa  321  9.000000000000001e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0090  dipeptide transporter  61.59 
 
 		 300 aa  321  9.000000000000001e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.448882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4058  dipeptide transporter  61.59 
 
 		 300 aa  321  9.000000000000001e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12500  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  65.61 
 
 		 299 aa  319  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0323482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4910  dipeptide transporter  62.63 
 
 		 300 aa  318  9e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03393  dipeptide transporter  62.63 
 
 		 300 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.63 
 
 		 300 aa  318  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03344  hypothetical protein  62.63 
 
 		 300 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4034  dipeptide transporter  62.63 
 
 		 300 aa  318  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3861  dipeptide transporter  62.63 
 
 		 300 aa  318  9e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0173  dipeptide transporter  62.63 
 
 		 300 aa  318  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3741  dipeptide transporter  62.63 
 
 		 300 aa  318  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0222  dipeptide transport system permease protein  59.66 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  60.34 
 
 		 305 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0439  dipeptide transport system permease protein  58.64 
 
 		 305 aa  314  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.760641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0258  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC  58.64 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0245  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC  58.64 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3989  dipeptide transporter  60.21 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.59 
 
 		 287 aa  265  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.02 
 
 		 296 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.24 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.79 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.93 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  50.53 
 
 		 317 aa  254  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.642753 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 		 296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757763  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.18 
 
 		 304 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0339245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.162535  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.5 
 
 		 296 aa  252  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.208086  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.51 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00097283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.381943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.09 
 
 		 319 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 		 296 aa  248  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1233  peptide ABC transporter, permease protein  46.98 
 
 		 296 aa  246  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.4 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3777  peptide ABC transporter, permease protein  45.91 
 
 		 281 aa  245  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1803  peptide ABC transporter, permease protein  47.5 
 
 		 296 aa  245  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.13 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  46.43 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.83 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2582  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>