198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1246 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
508 aa  1019    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  35.85 
 
 
454 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  38.31 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.64 
 
 
762 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.75 
 
 
391 aa  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  30 
 
 
412 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.95 
 
 
487 aa  123  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.38 
 
 
635 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.32 
 
 
575 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.17 
 
 
549 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.92 
 
 
160 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.69 
 
 
360 aa  88.6  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  32.47 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.42 
 
 
269 aa  77  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.07 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.96 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  48.39 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.33 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.81 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  36.42 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.46 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  29.17 
 
 
379 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.31 
 
 
163 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.09 
 
 
323 aa  64.3  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.44 
 
 
266 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.39 
 
 
283 aa  64.3  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.58 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.58 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.58 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  32.39 
 
 
387 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.99 
 
 
329 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.83 
 
 
315 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  31.33 
 
 
406 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  36.15 
 
 
352 aa  60.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.47 
 
 
305 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.24 
 
 
395 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.5 
 
 
327 aa  60.1  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.29 
 
 
379 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.85 
 
 
309 aa  59.7  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 
358 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  34.03 
 
 
381 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  32.88 
 
 
383 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  31.54 
 
 
378 aa  58.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.45 
 
 
447 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.24 
 
 
395 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  30.82 
 
 
392 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.12 
 
 
319 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  44.62 
 
 
225 aa  58.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  57.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.24 
 
 
270 aa  57.4  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.78 
 
 
160 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  39.08 
 
 
228 aa  57  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  38.82 
 
 
234 aa  57  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  44.59 
 
 
228 aa  56.6  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  34.19 
 
 
313 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  47.54 
 
 
254 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  36.76 
 
 
264 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.33 
 
 
422 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.11 
 
 
306 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  42.25 
 
 
239 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  40.28 
 
 
242 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  28.65 
 
 
396 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  30.38 
 
 
426 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
356 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.15 
 
 
77 aa  54.7  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.54 
 
 
485 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.07 
 
 
306 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.86 
 
 
128 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.33 
 
 
587 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  38.57 
 
 
423 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  43.24 
 
 
478 aa  54.3  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.46 
 
 
206 aa  53.9  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2364  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.57 
 
 
92 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.83 
 
 
792 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.93 
 
 
236 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  29.33 
 
 
303 aa  52.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.85 
 
 
294 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.87 
 
 
230 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 
307 aa  52.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  33.09 
 
 
462 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  46.81 
 
 
231 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  45.16 
 
 
410 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
476 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 
229 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.21 
 
 
313 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.65 
 
 
321 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  45.16 
 
 
224 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  42.19 
 
 
243 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.54 
 
 
326 aa  50.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.39 
 
 
364 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.46 
 
 
864 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 
245 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0912  periplasmic protease  36.59 
 
 
482 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173688 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  31.86 
 
 
421 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  40.85 
 
 
224 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.85 
 
 
243 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  38.36 
 
 
478 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 
531 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6616  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 
239 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>